More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3545 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1677  amino acid adenylation domain-containing protein  45.94 
 
 
1058 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  45.89 
 
 
1070 aa  760    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3545  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1029 aa  2026    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  34.7 
 
 
1525 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  31.56 
 
 
1525 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  29.82 
 
 
2581 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  30.25 
 
 
1533 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  30.96 
 
 
1466 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  30.85 
 
 
1466 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 
1533 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  34.01 
 
 
2155 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.08 
 
 
1816 aa  338  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  38.19 
 
 
5230 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  34.5 
 
 
3291 aa  337  5.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.74 
 
 
1345 aa  334  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  37.37 
 
 
3224 aa  330  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  38.15 
 
 
3230 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  41.2 
 
 
3331 aa  330  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  40.48 
 
 
4090 aa  327  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  41.63 
 
 
1358 aa  327  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0572  amino acid adenylation domain protein  29.85 
 
 
1357 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.05 
 
 
3231 aa  325  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  40.43 
 
 
2883 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  33.99 
 
 
2628 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  34.23 
 
 
4747 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.83 
 
 
4960 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.61 
 
 
4960 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.72 
 
 
4968 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.27 
 
 
3235 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.61 
 
 
2156 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  39.39 
 
 
2875 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.99 
 
 
1833 aa  313  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.83 
 
 
2156 aa  313  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  39.84 
 
 
2174 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  36.38 
 
 
2625 aa  311  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  34.57 
 
 
1109 aa  311  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 
2410 aa  310  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  37.72 
 
 
3219 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  38.45 
 
 
5213 aa  308  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.38 
 
 
2156 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.88 
 
 
5596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.82 
 
 
2385 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.39 
 
 
2385 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.54 
 
 
7310 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.31 
 
 
3629 aa  303  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.66 
 
 
3308 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.28 
 
 
2385 aa  303  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  35.22 
 
 
2419 aa  302  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  41.18 
 
 
2606 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  36.61 
 
 
3296 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.41 
 
 
2385 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.55 
 
 
2385 aa  301  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  31.56 
 
 
2614 aa  301  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.55 
 
 
2385 aa  301  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.95 
 
 
2385 aa  300  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.31 
 
 
2370 aa  300  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.13 
 
 
2386 aa  299  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  30.13 
 
 
6403 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.86 
 
 
8915 aa  299  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  28.65 
 
 
2386 aa  299  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.32 
 
 
3432 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  36.62 
 
 
4449 aa  299  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.42 
 
 
7541 aa  299  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  33.79 
 
 
1126 aa  299  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.29 
 
 
2385 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  29.72 
 
 
2385 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.61 
 
 
5926 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.09 
 
 
9498 aa  298  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.06 
 
 
3018 aa  298  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.03 
 
 
5328 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  36.31 
 
 
3227 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  35.82 
 
 
2350 aa  296  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  32.78 
 
 
1990 aa  296  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.48 
 
 
5953 aa  295  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  32.04 
 
 
2187 aa  295  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.52 
 
 
7785 aa  295  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.76 
 
 
6889 aa  295  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.85 
 
 
1829 aa  295  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3729  amino acid adenylation domain-containing protein  40.46 
 
 
1368 aa  294  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.660471  normal  0.635061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.66 
 
 
3086 aa  294  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  29.64 
 
 
3102 aa  294  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  30.7 
 
 
9175 aa  293  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.14 
 
 
1714 aa  293  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.52 
 
 
1363 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  31.61 
 
 
1661 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  28.57 
 
 
2561 aa  293  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 
3086 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.32 
 
 
8914 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  32.69 
 
 
4106 aa  292  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 
3227 aa  292  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  36.6 
 
 
3221 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.24 
 
 
5149 aa  292  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.2 
 
 
4502 aa  291  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  35.02 
 
 
1130 aa  291  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.6 
 
 
5422 aa  291  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  37.98 
 
 
3180 aa  290  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.03 
 
 
6676 aa  290  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.5 
 
 
3348 aa  290  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.77 
 
 
2573 aa  290  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  35.29 
 
 
1369 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>