More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0572 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0572  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1357 aa  2820    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.56 
 
 		 6661 aa  683    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 		 3291 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.67 
 
 		 1833 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.33 
 
 		 1876 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  31.34 
 
 		 1816 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  29.27 
 
 		 1436 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.47 
 
 		 7712 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  30.43 
 
 		 6403 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.38 
 
 		 13537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  34.25 
 
 		 2606 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.63 
 
 		 4531 aa  569  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.26 
 
 		 6676 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.54 
 
 		 1829 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.79 
 
 		 5596 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.16 
 
 		 2628 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.17 
 
 		 2370 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.08 
 
 		 2448 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.64 
 
 		 4960 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.76 
 
 		 5953 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.14 
 
 		 6889 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  30.54 
 
 		 3328 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.84 
 
 		 3086 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  30.54 
 
 		 6072 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.86 
 
 		 2156 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  30.54 
 
 		 6081 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  30.54 
 
 		 3352 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  32.72 
 
 		 1556 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.19 
 
 		 4960 aa  559  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.42 
 
 		 5213 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.75 
 
 		 3086 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  32.9 
 
 		 1556 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  30.47 
 
 		 6006 aa  559  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.68 
 
 		 2867 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.79 
 
 		 2033 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.17 
 
 		 4968 aa  556  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.67 
 
 		 2156 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 		 3231 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.07 
 
 		 3308 aa  549  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.32 
 
 		 3498 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  29.29 
 
 		 2151 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  32.9 
 
 		 5230 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  32.96 
 
 		 2875 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.81 
 
 		 2385 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.65 
 
 		 2156 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  29.73 
 
 		 1369 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  27.74 
 
 		 2681 aa  545  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.4 
 
 		 4991 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  32.77 
 
 		 2625 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 		 1358 aa  543  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.22 
 
 		 2386 aa  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.45 
 
 		 2883 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  29.3 
 
 		 1370 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  32.09 
 
 		 4196 aa  539  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  32.22 
 
 		 1142 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.73 
 
 		 2385 aa  539  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  32.12 
 
 		 2155 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.73 
 
 		 1363 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.65 
 
 		 2385 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.41 
 
 		 2385 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 		 2193 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.46 
 
 		 9498 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.65 
 
 		 2385 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  32.42 
 
 		 2174 aa  533  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.72 
 
 		 2385 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.31 
 
 		 2385 aa  532  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.84 
 
 		 2581 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.68 
 
 		 3331 aa  532  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  33.05 
 
 		 2125 aa  532  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 3639 aa  529  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  29.82 
 
 		 2164 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.26 
 
 		 1806 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.96 
 
 		 2154 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.17 
 
 		 2385 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  32.84 
 
 		 1528 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.9 
 
 		 1336 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  30.38 
 
 		 1383 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.18 
 
 		 2386 aa  526  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  28.94 
 
 		 1345 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  32.04 
 
 		 1199 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.83 
 
 		 2385 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 		 1578 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  31.49 
 
 		 1405 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  29.86 
 
 		 2752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.32 
 
 		 2666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.81 
 
 		 4383 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  30.41 
 
 		 4572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  27.63 
 
 		 1331 aa  519  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  33.78 
 
 		 3235 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.59 
 
 		 4747 aa  516  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.34 
 
 		 4502 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  30.98 
 
 		 9175 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 		 1568 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  32.57 
 
 		 2151 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 		 2571 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  30.67 
 
 		 3695 aa  513  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  32.21 
 
 		 2137 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  30.31 
 
 		 4468 aa  513  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.8 
 
 		 4317 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 		 2571 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>