More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2681 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2681  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 466 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0693439  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2497  AMP-dependent synthetase and ligase  89.48 
 
 		 466 aa  764    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  59.07 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 707 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 512 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.89 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 548 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 548 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 548 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 503 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 471 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 517 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  29.91 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.23 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 511 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 544 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.63 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  28.95 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 		 549 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 506 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  21.81 
 
 		 487 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  29.05 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 506 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  21.98 
 
 		 490 aa  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  27.09 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  25.43 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.8 
 
 		 536 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  29.23 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 577 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.54 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  27.03 
 
 		 1070 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  28.64 
 
 		 530 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  24.79 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  24.79 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  25.11 
 
 		 504 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  23.11 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4754  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 573 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 523 aa  87  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  25.92 
 
 		 552 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  23.59 
 
 		 499 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  23.91 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  27.47 
 
 		 500 aa  86.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 508 aa  86.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  26.67 
 
 		 531 aa  86.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 520 aa  86.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  28.33 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  23.76 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 521 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  27.63 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  27.43 
 
 		 2167 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.59 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  21.27 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.72 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.28 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.28 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.72 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.72 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.28 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  27.53 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.2 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  29.98 
 
 		 524 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  28.71 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 		 561 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 		 2333 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1133  hypothetical protein  23.24 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.05 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.37 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>