More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2497 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2681  AMP-dependent synthetase and ligase  89.48 
 
 		 466 aa  787    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0693439  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2497  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 466 aa  917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  57.08 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 707 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  29.14 
 
 		 2167 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.8 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  28.73 
 
 		 509 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 552 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.72 
 
 		 474 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 507 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  29 
 
 		 548 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  29 
 
 		 548 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  28.38 
 
 		 548 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  26.25 
 
 		 504 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  28.39 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.57 
 
 		 512 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 577 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.4 
 
 		 536 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  23.71 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.41 
 
 		 514 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 522 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.66 
 
 		 520 aa  93.6  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  29.45 
 
 		 524 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  24.57 
 
 		 500 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 510 aa  93.6  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.27 
 
 		 583 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 520 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28 
 
 		 516 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 519 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  28.73 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  28.6 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  26.87 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  23.71 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  28.88 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  27.92 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 585 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 537 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 520 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 549 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  22.32 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 506 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  29.65 
 
 		 535 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 552 aa  90.9  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.8 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 506 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  29.34 
 
 		 506 aa  90.1  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 508 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  23.39 
 
 		 488 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  26.49 
 
 		 504 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.76 
 
 		 500 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  27.06 
 
 		 1070 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  28.44 
 
 		 530 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 506 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  23.39 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  28.6 
 
 		 518 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.69 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 561 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  23.39 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.69 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  29.75 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  28.01 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2155  hypothetical protein  26.28 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  22.05 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.71 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 		 525 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  28.57 
 
 		 524 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.71 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  26.62 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.71 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 550 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.57 
 
 		 546 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  23.49 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>