158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1778 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
523 aa  1048    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  70.89 
 
 
422 aa  548  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  66.12 
 
 
416 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  63.01 
 
 
420 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  60.22 
 
 
416 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  50.23 
 
 
444 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  52.72 
 
 
440 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  49.16 
 
 
434 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  52.46 
 
 
430 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  49.16 
 
 
434 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  49.16 
 
 
434 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  49.04 
 
 
423 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  49.04 
 
 
423 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  49.04 
 
 
423 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  52.17 
 
 
440 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  50.26 
 
 
433 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  48.8 
 
 
431 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  49.04 
 
 
423 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  48.27 
 
 
437 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  49.04 
 
 
423 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  49.04 
 
 
423 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  49.04 
 
 
423 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  49.04 
 
 
423 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  52.96 
 
 
442 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  48.82 
 
 
432 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  47.61 
 
 
427 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  50.14 
 
 
444 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  52.45 
 
 
413 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  52.59 
 
 
413 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  52.32 
 
 
412 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  47.86 
 
 
434 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  45.75 
 
 
447 aa  346  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  46.24 
 
 
419 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  46.24 
 
 
419 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  46.24 
 
 
419 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  42.11 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  40.2 
 
 
484 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  41.84 
 
 
435 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  41.47 
 
 
441 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  39.69 
 
 
419 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  39.39 
 
 
430 aa  233  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  36.99 
 
 
460 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  39.63 
 
 
416 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  39.04 
 
 
441 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  38.68 
 
 
402 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  37.31 
 
 
449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  36.91 
 
 
451 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  36.98 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  37.96 
 
 
437 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  37.56 
 
 
398 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  35.39 
 
 
401 aa  200  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  40.11 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  34.19 
 
 
435 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 
434 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  38.5 
 
 
402 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  34.53 
 
 
401 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  36.46 
 
 
408 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  33.5 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  34.18 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  34.18 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  36.73 
 
 
394 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  36.9 
 
 
479 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  36.19 
 
 
394 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  36.19 
 
 
394 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  37.74 
 
 
470 aa  173  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  36.9 
 
 
404 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  36.36 
 
 
406 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  35.18 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  35.99 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  34.26 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  36.44 
 
 
401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  39.23 
 
 
414 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  34.26 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  36.03 
 
 
430 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  33.16 
 
 
440 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  33.8 
 
 
456 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  34.62 
 
 
419 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  31.58 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  30.38 
 
 
413 aa  123  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  31.23 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  31.05 
 
 
381 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  43.53 
 
 
1443 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  33.73 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  25.44 
 
 
359 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  25.78 
 
 
356 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  25.44 
 
 
359 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  25.78 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  26.62 
 
 
346 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  24.65 
 
 
352 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  25.8 
 
 
353 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  27.17 
 
 
481 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  43.37 
 
 
1486 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  24.77 
 
 
315 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  24.03 
 
 
354 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  35.59 
 
 
124 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  28.82 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7089  Dyp-type peroxidase family protein  27.65 
 
 
359 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.129458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  23.67 
 
 
368 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10814  hypothetical protein  23.1 
 
 
335 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  25.42 
 
 
340 aa  60.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>