165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3404 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  100 
 
 		 422 aa  844    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  70.48 
 
 		 523 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  67.31 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  61.89 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  63.42 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  51.64 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  52.48 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  55.81 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  54.57 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  51.36 
 
 		 423 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  49.88 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  51.36 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  49.88 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  49.64 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  51.5 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  51.5 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  52.32 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  51.5 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  51.5 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  51.5 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  53.26 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  53.28 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  52.41 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  50.62 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  52.05 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  56.28 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  50.77 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  54.86 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  49.64 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  50.94 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  50.53 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  48.83 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  49.77 
 
 		 419 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  49.77 
 
 		 419 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  49.77 
 
 		 419 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  42.93 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  42.31 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  44.5 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  44.68 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  42.41 
 
 		 419 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  41.65 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  39.09 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  37.63 
 
 		 451 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  40.62 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  40.89 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  36.99 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  37.87 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  38.1 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  38.9 
 
 		 449 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  37.73 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  39.28 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  39.74 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  34.97 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  34.52 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  40.21 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  35.23 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  34.5 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  39.74 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  38.04 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  35.12 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  35.12 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  37.5 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  37.5 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  38.23 
 
 		 479 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  40.95 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  39.3 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  37.84 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  38.11 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  33.75 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  37 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  36.81 
 
 		 419 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  37.9 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  34.64 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  37.76 
 
 		 442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  35.44 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  34.44 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  33.87 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  35.73 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  32.56 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  33.42 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  31.95 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  29.74 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  36 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  22.32 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  24.31 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  28.49 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  36.47 
 
 		 1443 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  26.18 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  30.47 
 
 		 124 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  23.78 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  27.49 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  24.65 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  24.65 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  25.94 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  26.61 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  24.3 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  26.9 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  26.9 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  25.47 
 
 		 311 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  25.36 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>