127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1777 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
419 aa  809    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  53.61 
 
 
430 aa  360  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  48.97 
 
 
442 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  47.26 
 
 
456 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  51.94 
 
 
479 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  45.61 
 
 
430 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  43.44 
 
 
403 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  41.82 
 
 
419 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  40.38 
 
 
484 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  40.74 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  39.94 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  41.59 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  36.85 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  41.9 
 
 
408 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  42.48 
 
 
402 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  36.36 
 
 
401 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  36.43 
 
 
434 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  42.66 
 
 
416 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  43.02 
 
 
401 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  36.75 
 
 
449 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  36.03 
 
 
435 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  37.85 
 
 
436 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  35.92 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  39.39 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  40.3 
 
 
402 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  34.99 
 
 
451 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  38.84 
 
 
440 aa  199  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  34.99 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  45.76 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  38.72 
 
 
441 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  43.24 
 
 
406 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  42.57 
 
 
408 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  39.1 
 
 
428 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  38.32 
 
 
394 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  34.19 
 
 
409 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  34.19 
 
 
409 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  35.04 
 
 
423 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  37.54 
 
 
394 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  37.54 
 
 
394 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  40.05 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  34.67 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  34.67 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  37.88 
 
 
420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  34.67 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  34.67 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  34.67 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  34.79 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  34.47 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  40.35 
 
 
470 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  35.88 
 
 
427 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  33.41 
 
 
434 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  33.41 
 
 
434 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  33.02 
 
 
434 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  37.09 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  33.98 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  33.64 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  39.48 
 
 
414 aa  173  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  32.3 
 
 
437 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  34.11 
 
 
401 aa  170  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  34.12 
 
 
444 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  33.02 
 
 
431 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  39.29 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  37.94 
 
 
440 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  39.27 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  39.27 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  39.27 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  36.49 
 
 
412 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  32.66 
 
 
442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  36.59 
 
 
416 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  35.16 
 
 
523 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  35.63 
 
 
413 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  33.49 
 
 
434 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  31.12 
 
 
432 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  34.77 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  35.66 
 
 
381 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  31.03 
 
 
444 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  34.49 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  30.73 
 
 
440 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  31.4 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  33 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  34.63 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  44.74 
 
 
124 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  29.33 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  30.16 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  23.24 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  32.45 
 
 
341 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  21.36 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  26.69 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28340  hypothetical protein  30.73 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.569252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  30 
 
 
340 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3688  Dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.793167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0516  dyp-type peroxidase family protein  30.58 
 
 
485 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3201  Dyp-type peroxidase family  31.08 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3458  Dyp-type peroxidase family protein  29.03 
 
 
299 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4562  Dyp-type peroxidase family  28.49 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2298  Dyp-type peroxidase  29.9 
 
 
293 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427507  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  25.45 
 
 
314 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2468  hypothetical protein  33.75 
 
 
293 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  32.67 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  32 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>