112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
440 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  65.59 
 
 
401 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  56.59 
 
 
414 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  59.78 
 
 
408 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  58.22 
 
 
403 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  58.4 
 
 
470 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  59.16 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  59.45 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  56.77 
 
 
404 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  53.12 
 
 
394 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  48.7 
 
 
413 aa  360  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  55.73 
 
 
402 aa  358  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  53.39 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  53.39 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  56.13 
 
 
414 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  52.01 
 
 
398 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  48.96 
 
 
440 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  44.04 
 
 
381 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  38.35 
 
 
479 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  38.11 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  37.76 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.53 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  37.97 
 
 
434 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  39.52 
 
 
420 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  36.8 
 
 
409 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  36.8 
 
 
409 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  35.04 
 
 
451 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  36.55 
 
 
484 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  35.7 
 
 
460 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  36.79 
 
 
449 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.29 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  37.56 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  33.76 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  36.13 
 
 
435 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  38.57 
 
 
419 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  35.91 
 
 
430 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  37.35 
 
 
419 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  37.14 
 
 
416 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  36.88 
 
 
441 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  37.86 
 
 
442 aa  190  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  36.29 
 
 
456 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  35.34 
 
 
435 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  34.16 
 
 
423 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  34.38 
 
 
423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  37.07 
 
 
401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  34.38 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  34.38 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  34.38 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  34.38 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  34.38 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  35.11 
 
 
402 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  34.16 
 
 
423 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  34.02 
 
 
434 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  34.02 
 
 
434 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  33.79 
 
 
434 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  35.73 
 
 
430 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  33.11 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  35.68 
 
 
413 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  35.16 
 
 
430 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  36.58 
 
 
412 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  33.63 
 
 
431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  36 
 
 
420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  33.41 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  36.3 
 
 
416 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  35.16 
 
 
422 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  33.17 
 
 
442 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  36.55 
 
 
416 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  33.56 
 
 
444 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  32.47 
 
 
433 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  33.16 
 
 
523 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  34.51 
 
 
413 aa  153  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  31.64 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  30.99 
 
 
440 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  31.43 
 
 
444 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  31.19 
 
 
440 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  28.8 
 
 
432 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  31.92 
 
 
447 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  31.07 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  31.07 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  31.07 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  34.11 
 
 
399 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  40.16 
 
 
124 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  27.36 
 
 
312 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  25 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  22.01 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  25.65 
 
 
311 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  25.65 
 
 
311 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  25.65 
 
 
311 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  25.23 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  25.65 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  23.11 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  24.78 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3223  Dyp-type peroxidase family protein  24.77 
 
 
311 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  22.03 
 
 
314 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  24.89 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  24.89 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  24.89 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  24.89 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0473  Dyp-type peroxidase  26.88 
 
 
307 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  26.62 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>