131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3900 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
435 aa  880    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  60.71 
 
 
441 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  57.58 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  61.87 
 
 
430 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  59.74 
 
 
419 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  60.53 
 
 
484 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  56.48 
 
 
441 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  55.24 
 
 
416 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  54.87 
 
 
449 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  53.77 
 
 
428 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  50.43 
 
 
460 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  55.26 
 
 
402 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  52.12 
 
 
451 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  51.15 
 
 
437 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  46.91 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  46.91 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  47.67 
 
 
436 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  44.3 
 
 
409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  44.3 
 
 
409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  42.48 
 
 
401 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  43.75 
 
 
401 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  44.36 
 
 
422 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  45.53 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  44.41 
 
 
456 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  40.99 
 
 
398 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  41.23 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  37.27 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  37.29 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  36.07 
 
 
434 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  37.05 
 
 
423 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  37.05 
 
 
423 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  37.05 
 
 
423 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  37.05 
 
 
423 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  37.05 
 
 
423 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  41.62 
 
 
523 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  37.05 
 
 
423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  39.41 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  42.97 
 
 
416 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  39.79 
 
 
420 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  36.74 
 
 
431 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  36.07 
 
 
434 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  36.07 
 
 
434 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  36.58 
 
 
423 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  40.96 
 
 
402 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  40.9 
 
 
394 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  40.21 
 
 
412 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  41.3 
 
 
403 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  40.63 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  40.63 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  41.98 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  40.9 
 
 
408 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  38.95 
 
 
442 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  38.52 
 
 
444 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  34.25 
 
 
440 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  35.94 
 
 
427 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  40.4 
 
 
406 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  38.23 
 
 
434 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  34.65 
 
 
440 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  39.73 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  38.72 
 
 
413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  39.01 
 
 
413 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  37.89 
 
 
433 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  40 
 
 
404 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  35.15 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  35.92 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  39.95 
 
 
408 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  37.53 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  37.53 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  37.53 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  40.46 
 
 
419 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  43.24 
 
 
414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  36.03 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  40.06 
 
 
401 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  39.8 
 
 
470 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  35.39 
 
 
447 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  40.22 
 
 
430 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  36.9 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  36.13 
 
 
440 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  34.36 
 
 
413 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  33.25 
 
 
440 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  32.7 
 
 
381 aa  136  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  46.88 
 
 
124 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4479  putative melanin biosynthesis protein TyrA  28 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  26.26 
 
 
302 aa  60.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4562  Dyp-type peroxidase family  27.87 
 
 
335 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  24.22 
 
 
316 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  26.92 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  27.27 
 
 
481 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  25.89 
 
 
300 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  25.26 
 
 
368 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  25.34 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  24.46 
 
 
314 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  25.87 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  25.87 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  26.22 
 
 
359 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  26.22 
 
 
359 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  24.56 
 
 
300 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  25.35 
 
 
315 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  23.67 
 
 
323 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  26.22 
 
 
353 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>