134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7007 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 		 484 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  62.04 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  61.64 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  58.42 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  53.56 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  60.58 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  58.81 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  59.17 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  60.53 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  53.11 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  56.84 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  56.3 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  54.65 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  55.47 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  51.69 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  48.71 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  48.45 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  46.26 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  43.42 
 
 		 401 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  40.52 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  40.52 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  41.75 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  42.93 
 
 		 412 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  37.24 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  37.24 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  40.76 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  43.9 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  37.24 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  37.24 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  37.24 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  40.37 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  37.47 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  37.47 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  37.47 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  37.24 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  37.02 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  37.47 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  37.01 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  41.02 
 
 		 427 aa  252  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  37 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  40.33 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  42.86 
 
 		 479 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  40.09 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  39.81 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  39.81 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  39.81 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  43.18 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  40.21 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  40.7 
 
 		 523 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  38.44 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  40.21 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  41.32 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  38.96 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  39.69 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  40.8 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  40.62 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  38.83 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  37.35 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  38.7 
 
 		 420 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  38.64 
 
 		 444 aa  224  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  40.43 
 
 		 416 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  37.03 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  38.56 
 
 		 404 aa  223  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  37.68 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  40.38 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  37.68 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  39.2 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  38.2 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  38.2 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  38.3 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  40.85 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  38.67 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  37.93 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  35.94 
 
 		 413 aa  207  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  35.82 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  40.48 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  36.55 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  39.07 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  34.02 
 
 		 414 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  34.4 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  33.07 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  49.22 
 
 		 124 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  24.47 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  25.73 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  25.96 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  30.81 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  23.14 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  26.69 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  26.24 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  22.05 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  27.57 
 
 		 360 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  24.74 
 
 		 302 aa  53.9  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  23.16 
 
 		 314 aa  53.9  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  30.81 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  27 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00060  Dyp-type peroxidase protein  23.97 
 
 		 293 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0249  Dyp-type peroxidase family  27.81 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.755486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  29.17 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3201  Dyp-type peroxidase family  24.62 
 
 		 340 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  23.05 
 
 		 312 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>