152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0431 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  88.75 
 
 
413 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 
412 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  67.32 
 
 
413 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  59.08 
 
 
423 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  59.08 
 
 
423 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  59.08 
 
 
423 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  60.05 
 
 
423 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  60.05 
 
 
423 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  59.08 
 
 
423 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  59.08 
 
 
423 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  58.68 
 
 
431 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  59.57 
 
 
423 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  59.03 
 
 
440 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  58.01 
 
 
432 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  58.98 
 
 
437 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  60.21 
 
 
440 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  57.97 
 
 
427 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  57.31 
 
 
434 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  57.31 
 
 
434 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  60.21 
 
 
430 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  56.73 
 
 
434 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  60.43 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  55.95 
 
 
444 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  59.79 
 
 
444 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  59.64 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  55.53 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  56.57 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  56.01 
 
 
422 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  53.3 
 
 
419 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  53.3 
 
 
419 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  53.3 
 
 
419 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  52.46 
 
 
523 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  50.53 
 
 
420 aa  362  9e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  52.03 
 
 
416 aa  358  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  52.05 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  42.6 
 
 
420 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  42.93 
 
 
484 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  43.97 
 
 
419 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  44.35 
 
 
441 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  41.51 
 
 
402 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  40.05 
 
 
416 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  43.89 
 
 
430 aa  243  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  39.95 
 
 
441 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  40.58 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  37.9 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  37.67 
 
 
437 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  39.59 
 
 
449 aa  227  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.96 
 
 
428 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  37.66 
 
 
401 aa  223  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  36.92 
 
 
434 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  36.05 
 
 
435 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  35.75 
 
 
460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  37.47 
 
 
401 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  36.5 
 
 
436 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  34.47 
 
 
409 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  34.47 
 
 
409 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  37.76 
 
 
403 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  37.76 
 
 
402 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  37.86 
 
 
398 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  36.19 
 
 
394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  36.19 
 
 
394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  36.19 
 
 
394 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  36.87 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  36.83 
 
 
479 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  36.58 
 
 
440 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  38.93 
 
 
414 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  34.85 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  35.22 
 
 
404 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  36.49 
 
 
419 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  35.98 
 
 
470 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  34.67 
 
 
406 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  34.32 
 
 
401 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  33.6 
 
 
456 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  31.79 
 
 
435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  34.4 
 
 
430 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  32.98 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  34.05 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  31.55 
 
 
413 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  32.69 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  31.83 
 
 
381 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  40.77 
 
 
124 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  26.95 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  27.76 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  27.05 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  26.92 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  27.97 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  26.15 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  26.15 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  26.15 
 
 
306 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  26.15 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  26.6 
 
 
311 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  26.04 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  33.11 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  26.28 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  24.67 
 
 
316 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  25 
 
 
307 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  20.92 
 
 
307 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  25.55 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  25.89 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>