135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3078 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  100 
 
 		 430 aa  848    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  57.31 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  48.55 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  42.92 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  41.35 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  46.85 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  45.4 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  44.78 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  40.82 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  39.49 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  40.51 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  42.93 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  42.34 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  40.28 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  40.06 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  36.82 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  40.21 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  42.54 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  37.89 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  41.62 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  43.41 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  42.54 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  39.36 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  39.06 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  39.06 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  36.09 
 
 		 437 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  40.27 
 
 		 435 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  45.81 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  39.23 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  36.09 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  40.56 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.76 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  35.53 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  36.84 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  35.12 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  35.66 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  35.66 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  36.25 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  38.04 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  36.32 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  41.92 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  38.57 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  37.54 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  32.74 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  32.91 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  34.93 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  32.06 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  32.06 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  38.23 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  31.48 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  36.47 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  31.34 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  35.85 
 
 		 523 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  31.48 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  31.02 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  31.02 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  31.02 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  31.02 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  31.02 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  35.92 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  33.56 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  33.41 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  38.21 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  34.27 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  34.5 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  35.54 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  32.79 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  31.91 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  31.91 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  31.91 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  30.09 
 
 		 432 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  33.67 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  31.59 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  35.53 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  30.97 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  37.95 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  34.19 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  30.13 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  30.13 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  30.3 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  43.75 
 
 		 124 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  25.7 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  29.94 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  26.86 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0516  dyp-type peroxidase family protein  26.22 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  24.34 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  29.86 
 
 		 315 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  27.78 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  40.58 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  27.94 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  24.34 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2663  dyp-type peroxidase family protein  26.57 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  26.11 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0235  dyp-type peroxidase family protein  26.22 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  27.88 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  27.88 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  27.88 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1418  dyp-type peroxidase family protein  26.22 
 
 		 293 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1613  dyp-type peroxidase family protein  26.22 
 
 		 293 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>