107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
404 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  61.9 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  58.87 
 
 
408 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  58.26 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  56.77 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  59.66 
 
 
408 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  59.1 
 
 
406 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  56.82 
 
 
414 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  52.78 
 
 
394 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  54.85 
 
 
402 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  52.96 
 
 
394 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  52.96 
 
 
394 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  53.97 
 
 
470 aa  360  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  54.85 
 
 
398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  47.52 
 
 
413 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  55.93 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  46.97 
 
 
440 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  41.25 
 
 
436 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  45.92 
 
 
381 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  39 
 
 
434 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  39.06 
 
 
435 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  40.19 
 
 
479 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  40.43 
 
 
441 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  36.13 
 
 
428 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  39.63 
 
 
402 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  40 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  38.56 
 
 
484 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  38.18 
 
 
420 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  42.4 
 
 
430 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  42.34 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  39.89 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  35.77 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  37.89 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  38.99 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  42.54 
 
 
430 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  34.6 
 
 
451 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  40.68 
 
 
419 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.42 
 
 
437 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  38.17 
 
 
401 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  37.47 
 
 
441 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  36.09 
 
 
409 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  36.09 
 
 
409 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  37.28 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  34.44 
 
 
460 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  34.06 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  39.35 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  33.57 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  33.57 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  38.27 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  34.62 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  35.85 
 
 
430 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  34.34 
 
 
431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  39.2 
 
 
422 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  39.78 
 
 
419 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  36.46 
 
 
523 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  35.19 
 
 
427 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  34.75 
 
 
444 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  36.56 
 
 
413 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  32.54 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  32.54 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  32.54 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  32.54 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  33.1 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  32.54 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  33.69 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  33.69 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  35.22 
 
 
412 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  36.12 
 
 
413 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  34.14 
 
 
442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  35.92 
 
 
416 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  32.62 
 
 
444 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  32.89 
 
 
433 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  36.83 
 
 
399 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  31.23 
 
 
432 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  32.32 
 
 
434 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  30.97 
 
 
440 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  31.23 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  32.43 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  32.43 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  32.43 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  30.69 
 
 
447 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  40.16 
 
 
124 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  24.3 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  23.68 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3223  Dyp-type peroxidase family protein  23 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  25 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  29.66 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  22.03 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  22.03 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  22.03 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  26.59 
 
 
481 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  25.12 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  23 
 
 
311 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  23 
 
 
311 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  23 
 
 
311 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  23 
 
 
306 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  21.12 
 
 
314 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  33.1 
 
 
470 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  33.1 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  31.44 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0133678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>