135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3598 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 		 440 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  95 
 
 		 440 aa  808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  84 
 
 		 432 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  67.37 
 
 		 444 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  71.69 
 
 		 433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  63.27 
 
 		 444 aa  551  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  63.08 
 
 		 434 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  62.15 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  60.29 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  58.47 
 
 		 437 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  58.99 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  58.99 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  58.8 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  58.8 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  58.8 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  62.73 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  58.8 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  58.8 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  57.92 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  57.92 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  58.16 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  58.33 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  59.57 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  59.28 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  59.38 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  59.74 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  59.73 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  53.8 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  52.72 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  50.24 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  50.24 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  50.24 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  51.63 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  49.73 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  50.41 
 
 		 416 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  39.73 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  38.96 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  36.68 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  37.04 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  37.63 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  37.53 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  36.94 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  37.53 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  33.48 
 
 		 460 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  34.93 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  33.77 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  33.77 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  34.1 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  34.78 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  34.02 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  34.36 
 
 		 435 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  32.98 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  34.85 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  33.5 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  32.99 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  34.49 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  36 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  34.41 
 
 		 394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  34.14 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  34.14 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  34.24 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  32.35 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  31.82 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  35.21 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  32.07 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  32.8 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  31.19 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  29.31 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  31.4 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  29.74 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  31.99 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  31.23 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  30.4 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  30.77 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  30.02 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  27.63 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  27.53 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  29.26 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  29.68 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  30.72 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  31.25 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.69 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0143  Dyp-type peroxidase  24.28 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641407  hitchhiker  0.00262856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  27.98 
 
 		 299 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  28.27 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  22.18 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  26.98 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1230  Dyp-type peroxidase family  22.51 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  27.57 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  27.57 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  27.87 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  27.57 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  27.57 
 
 		 306 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02331  hypothetical protein  22.51 
 
 		 299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02293  hypothetical protein  22.51 
 
 		 299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  28.17 
 
 		 314 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1248  Dyp-type peroxidase family protein  22.51 
 
 		 299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2586  dyp-type peroxidase family protein  22.51 
 
 		 299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>