112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2591 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  100 
 
 		 456 aa  887    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  73.98 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  41.83 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  43.9 
 
 		 484 aa  259  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  43.77 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  43.42 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  43.99 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  41.78 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  44.41 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  46.85 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  43.92 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  43.75 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  41.5 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  47.26 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  41.07 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  40.57 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  41.09 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  40.26 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  41.85 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  40 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  42.5 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  38.4 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  39.04 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  38.97 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  38.52 
 
 		 451 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  41.27 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  40.38 
 
 		 408 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  40.11 
 
 		 441 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  40.11 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  39.78 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  40.39 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  47.65 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  40.38 
 
 		 470 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  34.95 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  37.6 
 
 		 441 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  37.6 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  37.6 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 		 409 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 		 409 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  37.23 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  35.52 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  36.74 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  37.85 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  36.77 
 
 		 413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  30.97 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  31.84 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  30.53 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  30.53 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  32.8 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  36.26 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  32.19 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  29.91 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  34.92 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  31.08 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  32.89 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  29.91 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  29.52 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  33.87 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  29.07 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  29.07 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  34.47 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  37.08 
 
 		 399 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  32.45 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  29.07 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  29.07 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  29.07 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  33.8 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  32.88 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  35.73 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  29.82 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  31.73 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  32.98 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  33.97 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  33.97 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  33.97 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  30.99 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  30.68 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  29.74 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  30.63 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  32.07 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  44.7 
 
 		 124 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1043  Dyp-type peroxidase family protein  23.96 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.620298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  21.69 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  27.87 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0249  Dyp-type peroxidase family  28.4 
 
 		 308 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.755486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  27.47 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  26.85 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0493  Dyp-type peroxidase family protein  28.86 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  37.66 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  21.02 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  31.43 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  22.07 
 
 		 314 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2468  hypothetical protein  26.48 
 
 		 293 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  40.26 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  40 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  40 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  36 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  36 
 
 		 311 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>