126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1566 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 		 428 aa  862    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  64.69 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  64.68 
 
 		 451 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  65.35 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  60.99 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  60.26 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  58.81 
 
 		 484 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  57.07 
 
 		 416 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  52.89 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  57.54 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  54.11 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  53.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  54.07 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  50.38 
 
 		 441 aa  349  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  46.21 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  43.17 
 
 		 435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  43.4 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  41.04 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  42.4 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  39.59 
 
 		 409 aa  272  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  39.59 
 
 		 409 aa  272  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  39.79 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  37.63 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  38.02 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  35.16 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  41.05 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  37.31 
 
 		 442 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  34.7 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  34.7 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  37.73 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  38.21 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  40.43 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  37.96 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  36.13 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  38.28 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  36.48 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  34.45 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  36.48 
 
 		 394 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  36.48 
 
 		 394 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  37.53 
 
 		 440 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  37.89 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  35.28 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  37.83 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  34.31 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  38.46 
 
 		 416 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  34.2 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  38.02 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  32.87 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  32.87 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  32.87 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  32.87 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  32.87 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  37.56 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  37.56 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  37.56 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  32.63 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  37.23 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  35.4 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  35.98 
 
 		 420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  32.63 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  32.87 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  36.88 
 
 		 408 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  36.34 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  35.71 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  35.49 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  36.55 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  35.67 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  33.56 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  33.93 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  35.67 
 
 		 430 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  36.98 
 
 		 470 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  37.24 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  35.51 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  33.57 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  36.86 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  34.22 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  39.1 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  33.18 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  33.49 
 
 		 447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  32.12 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  29.18 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  53.97 
 
 		 124 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  26.17 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  24.4 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  28.95 
 
 		 302 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  27.09 
 
 		 312 aa  53.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  27.41 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  24.15 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  29.19 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  29.19 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  28.44 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  29.19 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  26.29 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  28.44 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  26.09 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3458  Dyp-type peroxidase family protein  27.75 
 
 		 299 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  27.08 
 
 		 315 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  26.96 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  26.39 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  27.31 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>