161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1950 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  92.24 
 
 
437 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 
451 aa  922    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  63.41 
 
 
428 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  62.86 
 
 
441 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  61.54 
 
 
420 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  59.95 
 
 
416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  58.42 
 
 
484 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  57.26 
 
 
449 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  53.48 
 
 
460 aa  435  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  57.44 
 
 
402 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  54.07 
 
 
419 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  53.85 
 
 
430 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  52.12 
 
 
435 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  49.62 
 
 
441 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  44.82 
 
 
436 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  44.53 
 
 
434 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  43.95 
 
 
435 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  41.35 
 
 
401 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  41.01 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  41.42 
 
 
409 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  41.42 
 
 
409 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  35.94 
 
 
435 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  37.9 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  37.9 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  37.9 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  37.44 
 
 
413 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  38.39 
 
 
413 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  37.53 
 
 
408 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  37.37 
 
 
412 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  38.78 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  34.6 
 
 
423 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  34.6 
 
 
423 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  34.6 
 
 
423 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  34.6 
 
 
423 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  33.72 
 
 
434 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  34.6 
 
 
423 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  33.88 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  33.88 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  33.41 
 
 
431 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  38.24 
 
 
420 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  34.51 
 
 
423 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  35.58 
 
 
430 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  34.59 
 
 
423 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  37.53 
 
 
422 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  34.51 
 
 
423 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  33.65 
 
 
437 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  38.52 
 
 
456 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  39.15 
 
 
399 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  35.6 
 
 
442 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  37.77 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  37.31 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  33.94 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  36.91 
 
 
523 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  36.3 
 
 
434 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  36.72 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 
427 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  36.44 
 
 
403 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  36.65 
 
 
416 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  34.74 
 
 
402 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  34.97 
 
 
430 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  33.72 
 
 
432 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  34.6 
 
 
404 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  34.01 
 
 
444 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  35.77 
 
 
440 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  35.68 
 
 
408 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  35.23 
 
 
406 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  34.9 
 
 
433 aa  204  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  34.43 
 
 
394 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  34.43 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  34.43 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  33.03 
 
 
447 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  35.52 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  34.99 
 
 
419 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  34 
 
 
470 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  35.69 
 
 
414 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  33.68 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  32.09 
 
 
413 aa  190  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 
440 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  34.78 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  30.34 
 
 
440 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  29.76 
 
 
381 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  48.06 
 
 
124 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  27.02 
 
 
481 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  23.55 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  22.59 
 
 
307 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  26 
 
 
301 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  26.59 
 
 
316 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  27.87 
 
 
299 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  27.32 
 
 
299 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  24.78 
 
 
311 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  27.87 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  30.57 
 
 
354 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2952  Dyp-type peroxidase family protein  28.65 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  24.28 
 
 
300 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  25.43 
 
 
300 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3458  Dyp-type peroxidase family protein  27.87 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  29.19 
 
 
311 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1230  Dyp-type peroxidase family  27.87 
 
 
299 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  29.73 
 
 
313 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  29.73 
 
 
313 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>