161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1809 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 		 433 aa  875    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  71.69 
 
 		 440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  71.92 
 
 		 440 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  65.78 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  64.3 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  58.37 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  59.06 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  60.19 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  57.79 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  55.37 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  59.04 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  55.42 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  55.18 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  55.18 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  55.18 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  52.98 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  55.18 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  55.42 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  52.98 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  53.57 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  55.18 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  55.18 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  57.87 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  58.65 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  56.63 
 
 		 413 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  56.57 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  57.57 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  50.26 
 
 		 523 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  51.5 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  48.46 
 
 		 416 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  49.73 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  48.32 
 
 		 419 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  48.32 
 
 		 419 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  48.32 
 
 		 419 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  49.87 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  41.22 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  39.64 
 
 		 484 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  39.73 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  38.93 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  37.08 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  37.99 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  37.89 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  37.97 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  35.62 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  36.83 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  35.55 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  33.81 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  34.9 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  36.97 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  33.83 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.14 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  32.98 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  38.93 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  35.36 
 
 		 398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  34.91 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  32.65 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  35.45 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  35.45 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  33.42 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  33.42 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  35.62 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  33.95 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  31.44 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  33.52 
 
 		 408 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  33.07 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  32.4 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  33.16 
 
 		 414 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  33.78 
 
 		 401 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  32.47 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  32.89 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  34.21 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  30.56 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  29.59 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  34.49 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  29.5 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  32.07 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  32 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  30.36 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  29.3 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  27.37 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.17 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  22.26 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  30.23 
 
 		 124 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  30.72 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  27.17 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  27.47 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  28.97 
 
 		 311 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  24.58 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  26.92 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  28.28 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  28.28 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  30.14 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  27.33 
 
 		 311 aa  53.5  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  28.28 
 
 		 313 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  27.44 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  26.63 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  33.58 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  31.12 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  29.35 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>