136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3369 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  95 
 
 
440 aa  828    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  100 
 
 
440 aa  899    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  83.29 
 
 
432 aa  742    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  70.48 
 
 
444 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  71.88 
 
 
433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  62.27 
 
 
444 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  62.91 
 
 
434 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  62 
 
 
447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  61.06 
 
 
423 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  61.06 
 
 
423 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  60.19 
 
 
423 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  60.19 
 
 
423 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  60.19 
 
 
423 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  60.19 
 
 
423 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  60.19 
 
 
423 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  58.84 
 
 
431 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  60.14 
 
 
423 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  59.38 
 
 
427 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  58.43 
 
 
434 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  58.95 
 
 
437 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  62.47 
 
 
430 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  58.43 
 
 
434 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  57.96 
 
 
434 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  59.48 
 
 
412 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  59.33 
 
 
413 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  59.43 
 
 
413 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  60.11 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  53.26 
 
 
422 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  52.17 
 
 
523 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  51.49 
 
 
416 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  50 
 
 
420 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  49.52 
 
 
419 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  49.52 
 
 
419 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  49.52 
 
 
419 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  50.68 
 
 
416 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  40 
 
 
420 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  38.44 
 
 
484 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  37.83 
 
 
416 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  36.68 
 
 
435 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  37.07 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  37.47 
 
 
441 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  36.36 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  37.8 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  33.26 
 
 
460 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  35.73 
 
 
430 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  34.04 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  34.04 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  33.69 
 
 
401 aa  199  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  35.13 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.14 
 
 
437 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  34.6 
 
 
401 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  34.1 
 
 
428 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  34.87 
 
 
435 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  34.02 
 
 
436 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  33.68 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  32.75 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  33.69 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  34.31 
 
 
403 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 
394 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  33.08 
 
 
394 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  33.08 
 
 
394 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  34.24 
 
 
414 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  31.55 
 
 
402 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  32.35 
 
 
408 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  35.4 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  31.88 
 
 
408 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  33.51 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  30.99 
 
 
440 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  29.25 
 
 
399 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  30.68 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  30.97 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  31.05 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  30.15 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  30.52 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  31.28 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  28.11 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  27.79 
 
 
435 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  30.61 
 
 
430 aa  123  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  28.88 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  29.95 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  30.72 
 
 
481 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  31.25 
 
 
124 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  22.54 
 
 
307 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  28.5 
 
 
299 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  28.8 
 
 
299 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.94 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0143  Dyp-type peroxidase  24.28 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641407  hitchhiker  0.00262856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  27.75 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1230  Dyp-type peroxidase family  22.51 
 
 
299 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  27.57 
 
 
306 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  27.57 
 
 
311 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  27.57 
 
 
311 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  27.57 
 
 
311 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02331  hypothetical protein  22.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02293  hypothetical protein  22.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2717  dyp-type peroxidase family protein  22.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1248  Dyp-type peroxidase family protein  22.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2586  dyp-type peroxidase family protein  22.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2803  dyp-type peroxidase family protein  22.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>