106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5006 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 		 414 aa  812    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  58.45 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  54.97 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  54.89 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  56.06 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  56.9 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  56.27 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  55.43 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  55.14 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  55.93 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  54.06 
 
 		 398 aa  359  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  53.65 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  52.81 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  52.81 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  53.48 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  45.83 
 
 		 413 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  42.45 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  41.9 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  39.27 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  43.09 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  42.33 
 
 		 479 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  43.68 
 
 		 419 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  38.19 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  43.25 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  36.41 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  36.41 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  39.09 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  43.25 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  35.34 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  40.99 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  38.93 
 
 		 441 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  41.62 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  36.49 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.11 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  37.82 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  42.24 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  41.5 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  40.64 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  38.22 
 
 		 449 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  41.5 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  39.26 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  36.76 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  36.76 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  36.76 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  36.76 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  36.76 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  36.76 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  36.76 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  37.9 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.79 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  36.64 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  35.21 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  36.62 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  35.21 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  35.21 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  37.91 
 
 		 413 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  40.7 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  36.03 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  35.85 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  34.4 
 
 		 437 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  37.38 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  39.1 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  37.9 
 
 		 430 aa  193  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  34.63 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  38.56 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  41.45 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  34.19 
 
 		 460 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  33.25 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  33.26 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  36.15 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  33.65 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  38.87 
 
 		 523 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  35.36 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  37 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  38.78 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  34.23 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  34.19 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  36.06 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  36.06 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  36.06 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  39.02 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  34.65 
 
 		 124 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  23.9 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  23.81 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  26.8 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  24.71 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  26.56 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0473  Dyp-type peroxidase  29.63 
 
 		 307 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2298  Dyp-type peroxidase  26.95 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0493  Dyp-type peroxidase family protein  26.7 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1043  Dyp-type peroxidase family protein  23.65 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.620298  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  31.25 
 
 		 346 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  26.48 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4565  Dyp-type peroxidase  26.05 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3798  Dyp-type peroxidase family protein  26.05 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262927  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  24.22 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  24.87 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3726  Dyp-type peroxidase family protein  26.05 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.747974  normal  0.228519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3688  Dyp-type peroxidase family protein  25.3 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.793167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4938  Dyp-type peroxidase family protein  27.16 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.769038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>