117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4289 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 		 441 aa  876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  70.21 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  62.11 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  62.7 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  65.35 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  63.83 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  61.64 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  55.51 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  59 
 
 		 416 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  61.05 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  60.42 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  57.32 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  57.26 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  52.74 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  48.43 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  47.72 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  46.82 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  42.89 
 
 		 401 aa  298  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  45.6 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  41.89 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  41.89 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  37.78 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  42.78 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  41.8 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  43.5 
 
 		 416 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  41.88 
 
 		 442 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  40.74 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  38.52 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  42.05 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  38.28 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  38.28 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  38.28 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  38.28 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  38.28 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  38.05 
 
 		 423 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  41.88 
 
 		 413 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  38.89 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  37.79 
 
 		 423 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  36.53 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  36.53 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  42.67 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  39.43 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  36.3 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  44.35 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  41.76 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  40.7 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  40.59 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  44.38 
 
 		 399 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  41.12 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  42.08 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  40 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  40 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  40 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  40.43 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  38.24 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  37.39 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  40.11 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  40.11 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  41.21 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  38.58 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  36.43 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  39.57 
 
 		 394 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  38.05 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  36.43 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  39.41 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  39.41 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  40.36 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  37.07 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  37.96 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  37.23 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  36.3 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  39.52 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  37.56 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  38.31 
 
 		 470 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  39.39 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  38.14 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  39.46 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  36.39 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  37.98 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  33.07 
 
 		 381 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  51.94 
 
 		 124 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  23.14 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  25.75 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  25 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  25.97 
 
 		 360 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  37.04 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  26.36 
 
 		 481 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  26.12 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  24.43 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0249  Dyp-type peroxidase family  23.77 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.755486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  26.26 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  24.43 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  24.43 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  24.43 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  25.14 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  31.34 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  29.17 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  23.11 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>