143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1956 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  100 
 
 		 442 aa  896    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  60.64 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  58.06 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  56.94 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  55.63 
 
 		 440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  55.92 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  58.05 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  60.05 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  56.59 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  56.59 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  60.43 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  60.11 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  56.59 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  55.07 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  55.5 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  53.86 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  56.1 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  56.1 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  55.85 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  55.61 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  55.61 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  55.61 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  55.61 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  55.61 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  57.57 
 
 		 433 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  55.45 
 
 		 447 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  54.63 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  54.57 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  51.56 
 
 		 523 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  52.97 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  52.97 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  52.97 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  50.93 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  51.04 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  51.49 
 
 		 416 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  42.51 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  41.75 
 
 		 484 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  41.69 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  40 
 
 		 441 aa  256  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  40.76 
 
 		 419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  40.1 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  37.93 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  37.13 
 
 		 460 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  38.99 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.31 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  38.36 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  37.2 
 
 		 401 aa  229  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  39.06 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  35.6 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  36.73 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.39 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  37.2 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  37.2 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  37.18 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  35.59 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  35.82 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  35.97 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  35.64 
 
 		 402 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  35.92 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  35.84 
 
 		 394 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  35.84 
 
 		 394 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  36.27 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  34.79 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  34.91 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  34.98 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  35.05 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  33.51 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  33.79 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  33.17 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  33.78 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  30.77 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  33.05 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  32.33 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  31.73 
 
 		 456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  33.07 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  33.25 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  32.01 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  32.58 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  30.43 
 
 		 440 aa  113  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  30.45 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  37.01 
 
 		 124 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  28.87 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  24 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  27.69 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  27.69 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  25.53 
 
 		 312 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  27.18 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  32 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  25.1 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2525  Dyp-type peroxidase family protein  25.32 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  0.073876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  25.63 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  21.79 
 
 		 307 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  24.68 
 
 		 311 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0639  Dyp-type peroxidase family protein  25.53 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  28.45 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5441  Dyp-type peroxidase family protein  24.77 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00060  Dyp-type peroxidase protein  26.34 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  21.54 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3798  Dyp-type peroxidase family protein  22.78 
 
 		 293 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262927  normal  0.114512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>