102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2530 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
401 aa  822    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  57.04 
 
 
435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  57.28 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  58.4 
 
 
436 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  47.64 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  46.07 
 
 
420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  45.13 
 
 
419 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  42 
 
 
460 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  42.71 
 
 
416 aa  295  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  42.51 
 
 
451 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  46.84 
 
 
441 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  43.68 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  45.75 
 
 
435 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  41.42 
 
 
449 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  43.15 
 
 
430 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  41.04 
 
 
437 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  41.69 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  39.89 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  39.37 
 
 
441 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  38.65 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  38.65 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  41.85 
 
 
456 aa  236  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  39.3 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 
442 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  36.62 
 
 
423 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  36.6 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  36.6 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  36.82 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  36.6 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  36.6 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  36.6 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  36.38 
 
 
423 aa  219  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  35.68 
 
 
423 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  40.16 
 
 
479 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  39.47 
 
 
416 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  36.97 
 
 
435 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  39.84 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  37.87 
 
 
431 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  37.01 
 
 
427 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  36.75 
 
 
430 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  37.47 
 
 
412 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  38.11 
 
 
402 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  35.51 
 
 
437 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  39.68 
 
 
408 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  37.4 
 
 
419 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  37.73 
 
 
413 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  38.17 
 
 
404 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  36.76 
 
 
416 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  37.94 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  38.99 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  34.78 
 
 
440 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  35.52 
 
 
444 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  34.6 
 
 
440 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  34.79 
 
 
434 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  34.79 
 
 
434 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  34.72 
 
 
434 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  41.5 
 
 
414 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  33.1 
 
 
432 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  36.51 
 
 
420 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  35.75 
 
 
442 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  37.23 
 
 
401 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  36.07 
 
 
444 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  34.91 
 
 
433 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  36.31 
 
 
394 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  35.36 
 
 
523 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  37.07 
 
 
440 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  36.04 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  36.04 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  36.89 
 
 
419 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  34.29 
 
 
434 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  36.89 
 
 
419 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  36.89 
 
 
419 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  36.99 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  35.64 
 
 
399 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  34.33 
 
 
447 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  35.89 
 
 
408 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  36.32 
 
 
414 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  33.74 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  33.88 
 
 
413 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  33.07 
 
 
440 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  30.33 
 
 
381 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  38.97 
 
 
124 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  26.14 
 
 
307 aa  56.2  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1730  Dyp-type peroxidase family protein  22.75 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104157  normal  0.0665076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  23.93 
 
 
316 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0249  Dyp-type peroxidase family  25.74 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.755486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.1 
 
 
301 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  25.83 
 
 
340 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  25.58 
 
 
307 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1043  Dyp-type peroxidase family protein  22.55 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.620298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  25.73 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  28.87 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  28.99 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  24.77 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  30.56 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  23.24 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  24 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0639  Dyp-type peroxidase family protein  25.93 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  34.21 
 
 
354 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  27.35 
 
 
359 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>