85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1171 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
413 aa  833    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  51.08 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  51.55 
 
 
408 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  50.57 
 
 
404 aa  342  8e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  50.83 
 
 
470 aa  336  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  49.18 
 
 
408 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  50 
 
 
401 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  47.51 
 
 
406 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  47.49 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  48.04 
 
 
403 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  48.06 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  47.73 
 
 
394 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  47.73 
 
 
394 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  47.73 
 
 
394 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  49.29 
 
 
414 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  47.21 
 
 
414 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  40.92 
 
 
440 aa  223  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  37.2 
 
 
484 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  37.43 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  37.78 
 
 
381 aa  196  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  34.68 
 
 
402 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  33.78 
 
 
451 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  37.3 
 
 
430 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  33.78 
 
 
437 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 
428 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  34.01 
 
 
479 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  36.39 
 
 
441 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  34.82 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  36.31 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  31.91 
 
 
435 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  32.21 
 
 
435 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 
434 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  34.63 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  35.2 
 
 
419 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  33.91 
 
 
441 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  37.66 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  32.17 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  35.93 
 
 
442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  33.88 
 
 
401 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  31.95 
 
 
460 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  33.79 
 
 
456 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  29.47 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  29.47 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  33.87 
 
 
416 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  31.22 
 
 
433 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  29.18 
 
 
431 aa  142  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  29.8 
 
 
437 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  33.45 
 
 
430 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  32.18 
 
 
442 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  29.28 
 
 
401 aa  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  31.2 
 
 
420 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  30.56 
 
 
430 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  33.6 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  32.79 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  29.25 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  29.25 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  29.25 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  29.25 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  29.25 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  29.25 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  29.66 
 
 
419 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  29.66 
 
 
419 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  29.66 
 
 
419 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  30.11 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  31.55 
 
 
413 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  28.47 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  28.47 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  29.01 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  30.23 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  28.44 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  31.28 
 
 
427 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  31.55 
 
 
412 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  35.96 
 
 
399 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  30.75 
 
 
413 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  30.94 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  31.47 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  27.06 
 
 
444 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  27.96 
 
 
440 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  27.69 
 
 
440 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  28.11 
 
 
447 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  25.84 
 
 
432 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  37.8 
 
 
124 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4562  Dyp-type peroxidase family  27.64 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  23.17 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  22.71 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>