161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7482 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
416 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  65.1 
 
 
422 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  62.26 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  60.22 
 
 
523 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  54.76 
 
 
420 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  49.64 
 
 
431 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  50.48 
 
 
423 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  50.48 
 
 
423 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  50.6 
 
 
423 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  50.48 
 
 
423 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  50.48 
 
 
423 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  50.6 
 
 
423 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  50.48 
 
 
423 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  47.38 
 
 
434 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  50.12 
 
 
423 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  51.63 
 
 
440 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  51.49 
 
 
440 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  49.04 
 
 
437 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  50.41 
 
 
434 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  51.78 
 
 
430 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  50.41 
 
 
434 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  47.64 
 
 
432 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  49.19 
 
 
444 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  52.19 
 
 
427 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  48.22 
 
 
444 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  51.94 
 
 
413 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  51.91 
 
 
442 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  52.6 
 
 
413 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  48.46 
 
 
433 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  52.05 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  48.83 
 
 
447 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  48.94 
 
 
434 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  47.64 
 
 
419 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  47.64 
 
 
419 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  47.64 
 
 
419 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  43.5 
 
 
441 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  41.55 
 
 
420 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  42.2 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  41.98 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  41.32 
 
 
484 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  41.44 
 
 
430 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  39.29 
 
 
449 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  38.24 
 
 
460 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  38.24 
 
 
416 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  39.59 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  37.57 
 
 
451 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  38.02 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  34.76 
 
 
401 aa  216  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  37.57 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  36.36 
 
 
434 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  36.62 
 
 
435 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  36.86 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  39.14 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  38.44 
 
 
402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  35.92 
 
 
409 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  35.92 
 
 
409 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  40.41 
 
 
394 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  40.41 
 
 
394 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  40.41 
 
 
394 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  35.42 
 
 
436 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  37.2 
 
 
408 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  38.61 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  37.5 
 
 
403 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  38.83 
 
 
470 aa  176  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  37.1 
 
 
479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  36.3 
 
 
440 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  39.29 
 
 
419 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  40.48 
 
 
399 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  34.96 
 
 
408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  35.92 
 
 
404 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  38.78 
 
 
414 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  33.87 
 
 
456 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  34.35 
 
 
414 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  35.5 
 
 
406 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  38.21 
 
 
430 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  30.24 
 
 
435 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  32.16 
 
 
413 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  35.85 
 
 
401 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  34.41 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  33.24 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  34.38 
 
 
124 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  25.61 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  31.92 
 
 
473 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  26.18 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  25.26 
 
 
368 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  25 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  26.14 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  24.31 
 
 
312 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  25.44 
 
 
316 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  36.71 
 
 
1443 aa  56.6  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  25.37 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  24.56 
 
 
352 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  23.08 
 
 
301 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  24.91 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  25.37 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  24.91 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  26.83 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  26.87 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  24.65 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>