92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
414 aa  819    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  60.53 
 
 
440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  58.17 
 
 
408 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  59.66 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  58.17 
 
 
403 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  56.82 
 
 
404 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  54.69 
 
 
408 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  53.02 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  52.99 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  53.89 
 
 
402 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  53.48 
 
 
414 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  49.47 
 
 
394 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  49.21 
 
 
394 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  49.21 
 
 
394 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  49.46 
 
 
398 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  44.08 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  45.45 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  43.27 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  38.76 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  37.78 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  38.64 
 
 
434 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  36.5 
 
 
428 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  38.58 
 
 
420 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  39.22 
 
 
419 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  35.88 
 
 
479 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  40.18 
 
 
442 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  38.14 
 
 
441 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  37.07 
 
 
435 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  35.03 
 
 
441 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  34.55 
 
 
437 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  37.74 
 
 
430 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  32.23 
 
 
409 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  32.23 
 
 
409 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  34.48 
 
 
451 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  36.74 
 
 
456 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  33.88 
 
 
401 aa  188  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  38.04 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  34.33 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  34.73 
 
 
449 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  33.5 
 
 
435 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  36.55 
 
 
402 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  34.88 
 
 
416 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  36.32 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  34.02 
 
 
484 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  39.16 
 
 
419 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  34.76 
 
 
420 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  33.86 
 
 
444 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  34.49 
 
 
422 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  34.17 
 
 
434 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  33.84 
 
 
416 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  30.49 
 
 
434 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  30.27 
 
 
434 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  30.27 
 
 
434 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  33.07 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  31.25 
 
 
444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  30.95 
 
 
431 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  32.46 
 
 
423 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  32.2 
 
 
423 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  32.2 
 
 
423 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  32.2 
 
 
423 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  32.2 
 
 
423 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  32.2 
 
 
423 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  32.11 
 
 
423 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  32.81 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  34.76 
 
 
416 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  30.34 
 
 
430 aa  136  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  30.8 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  32.89 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  31.61 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  34.46 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  31.58 
 
 
523 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  29.76 
 
 
437 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  31.33 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  28.7 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  28.91 
 
 
440 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  29.4 
 
 
440 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  36.05 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  30.93 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  29.95 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  39.37 
 
 
124 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  23.55 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  23.37 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00482  putative melanin biosynthesis protein TyrA  27.27 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  24.65 
 
 
340 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  29.06 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5715  Dyp-type peroxidase family  27.76 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal  0.777307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  27.13 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  22.31 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  24.55 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  22.73 
 
 
301 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>