159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2354 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  100 
 
 
402 aa  809    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  60.52 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  61.05 
 
 
441 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  56.35 
 
 
416 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  59.17 
 
 
484 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  57.44 
 
 
451 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  55.61 
 
 
437 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  55.47 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  52.79 
 
 
460 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  54.07 
 
 
428 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  54.55 
 
 
419 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  53.02 
 
 
430 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  54.93 
 
 
435 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  52.04 
 
 
441 aa  355  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  44.55 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  47.14 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  45.71 
 
 
434 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  45.66 
 
 
435 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  42.69 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  43.28 
 
 
409 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  43.28 
 
 
409 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  39.34 
 
 
437 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  39.42 
 
 
431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  42.69 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  38.94 
 
 
423 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  38.3 
 
 
430 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  38.46 
 
 
423 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  38.46 
 
 
423 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  38.46 
 
 
423 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  38.46 
 
 
423 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  38.46 
 
 
423 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  38.46 
 
 
423 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  38.46 
 
 
423 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  41.51 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  40.57 
 
 
456 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  40.99 
 
 
413 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  41.91 
 
 
442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  36.75 
 
 
434 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  36.75 
 
 
434 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  36.67 
 
 
434 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  37.77 
 
 
427 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  39.67 
 
 
419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  39.67 
 
 
419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  39.67 
 
 
419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  40.87 
 
 
398 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  38.81 
 
 
442 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  38.02 
 
 
444 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  39.63 
 
 
404 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  38.12 
 
 
434 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  41.96 
 
 
403 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  41.08 
 
 
422 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  39.3 
 
 
402 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  41.81 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  36.05 
 
 
447 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  36.08 
 
 
435 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  38.3 
 
 
413 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  39.34 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  38.73 
 
 
523 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  39.78 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  37.8 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  35.88 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  37.66 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  38.01 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  37.53 
 
 
440 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  36.08 
 
 
444 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  37.57 
 
 
394 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  37.57 
 
 
394 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  39.25 
 
 
416 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  39.3 
 
 
430 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  36.97 
 
 
433 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  34.68 
 
 
413 aa  203  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  41.26 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  38.9 
 
 
408 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  39.18 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  37.75 
 
 
416 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  40 
 
 
419 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  37.75 
 
 
470 aa  189  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  35.11 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  36.55 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  32.5 
 
 
381 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  33.42 
 
 
440 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  45.74 
 
 
124 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  30.04 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  30.04 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  30.04 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  30.04 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  29.74 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  29.74 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  29.74 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  30 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1627  Dyp-type peroxidase family protein  28.06 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567886  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  25.2 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  28.99 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  27.42 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  32.39 
 
 
311 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.27 
 
 
301 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  29.47 
 
 
312 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  30.4 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0639  Dyp-type peroxidase family protein  28.86 
 
 
312 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  28.01 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>