118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4329 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  100 
 
 
419 aa  835    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 
419 aa  835    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 
419 aa  835    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  50.61 
 
 
431 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  54.3 
 
 
427 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  49.64 
 
 
423 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  50.85 
 
 
437 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  55.43 
 
 
412 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  49.64 
 
 
423 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  56.1 
 
 
413 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  49.15 
 
 
423 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  49.15 
 
 
423 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  49.07 
 
 
432 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  50 
 
 
444 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  49.15 
 
 
423 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  49.15 
 
 
423 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  49.15 
 
 
423 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  52.97 
 
 
442 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  52.29 
 
 
430 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  52.85 
 
 
440 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  48.18 
 
 
423 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  52.03 
 
 
440 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  47.6 
 
 
434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  47.6 
 
 
434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  47.12 
 
 
434 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  52.03 
 
 
444 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  50.95 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  48.89 
 
 
434 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  49.87 
 
 
447 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  49.4 
 
 
413 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  51.6 
 
 
422 aa  345  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  48.07 
 
 
416 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  47.98 
 
 
523 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  49.46 
 
 
416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  45.6 
 
 
420 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  42.23 
 
 
420 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  39.75 
 
 
484 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  39.95 
 
 
430 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  41.49 
 
 
441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  40.16 
 
 
416 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  41.32 
 
 
441 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  41.51 
 
 
419 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  37.16 
 
 
451 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  41.53 
 
 
402 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  35.8 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  38.03 
 
 
435 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.5 
 
 
428 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  34.73 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  34.48 
 
 
401 aa  193  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  37.73 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  36.89 
 
 
401 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  34.55 
 
 
436 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  34.09 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  35.02 
 
 
479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  34.3 
 
 
434 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  35.01 
 
 
409 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  35.01 
 
 
409 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  33.51 
 
 
435 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  35.03 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  39.27 
 
 
419 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  36.83 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  33.16 
 
 
408 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  32.67 
 
 
406 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  32.45 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  32.45 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  32.48 
 
 
408 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  31.93 
 
 
394 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  31.5 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  33.97 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  31.91 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  29.66 
 
 
413 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  35.77 
 
 
414 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  29.89 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  32.82 
 
 
470 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  34.92 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  32.5 
 
 
404 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  31.12 
 
 
440 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  30.99 
 
 
401 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  30 
 
 
414 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  30.58 
 
 
381 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  30.05 
 
 
440 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  31.3 
 
 
124 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.6 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  31.97 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  25.52 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  30.52 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  21.4 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  26.81 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  26.96 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  28.04 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  25.53 
 
 
314 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  24.69 
 
 
314 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1627  Dyp-type peroxidase family protein  25.43 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567886  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  28.25 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  23.4 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  25.93 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  25.32 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  27.2 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  26.67 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0493  Dyp-type peroxidase family protein  28.16 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>