139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4829 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  96.09 
 
 		 435 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 		 434 aa  892    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  70.02 
 
 		 436 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  58.02 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  47.4 
 
 		 420 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  48.45 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  46.91 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  44.44 
 
 		 449 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  44.61 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  46.82 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  43.28 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  44.22 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  43.4 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  45.71 
 
 		 402 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  42.16 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  43.35 
 
 		 419 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  41.77 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  39.72 
 
 		 401 aa  297  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  42.71 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  40.72 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  40.72 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  40.8 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  40.72 
 
 		 402 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  40.36 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  36.12 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  40.62 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  39.53 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  40.36 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  40.36 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  35.99 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  35.99 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  35.99 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  35.99 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  35.99 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  35.99 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  36.9 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  39.05 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  38.46 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  35.76 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  38.75 
 
 		 430 aa  236  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  39.95 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  35.31 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  40 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  33.94 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  36.59 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  33.94 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  33.94 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  34.7 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  36.47 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  40.26 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  38.21 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  37.97 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  39.53 
 
 		 414 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  37.86 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  37.24 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  36.92 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  37.78 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  36.06 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  35.63 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  36.43 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  36.05 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  35.55 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  37.02 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  36.88 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  36.6 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  34.97 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  37.16 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  32.87 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  34.16 
 
 		 434 aa  204  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  35.13 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  34.1 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  33.85 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 		 523 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  34.46 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  33.73 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  33.73 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  33.73 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  33.94 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  32.67 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  43.8 
 
 		 124 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  25.09 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  22.38 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  25.56 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  24.16 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  23.38 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  26.02 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3458  Dyp-type peroxidase family protein  28.98 
 
 		 299 aa  54.3  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  26.26 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  26.02 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  27.27 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  23.15 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  28.69 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  27.75 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  22.47 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  27.17 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  27.17 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  27.17 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  23.16 
 
 		 307 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>