64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5342 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 		 473 aa  936    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  28.81 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  33.78 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  32.96 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  32.96 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  32.96 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  31.86 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  35.21 
 
 		 444 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  31.19 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  28.13 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  34.47 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  32.17 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  28.48 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  26.6 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  27.11 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  30.16 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  28.6 
 
 		 1443 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  27.71 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  27.8 
 
 		 470 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  27.89 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  28.25 
 
 		 484 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  28.44 
 
 		 1486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  26.73 
 
 		 1489 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  28.64 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  28.24 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  28.78 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  30.58 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  33.73 
 
 		 523 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  36 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  33.78 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  31.92 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  33.78 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  30.81 
 
 		 434 aa  57  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  31.97 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  31.97 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  31.97 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  33.11 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  27.23 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  27.23 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  27.23 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  31.76 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  28.38 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  27.04 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  29.58 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  33.58 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  28.38 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  32 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  29.33 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  29.63 
 
 		 404 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  26.53 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  31.39 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  28.65 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  30.27 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  28.87 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  27.12 
 
 		 481 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  27.01 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  28.99 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>