39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1442 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  100 
 
 		 480 aa  999    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  32.25 
 
 		 488 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  33.74 
 
 		 504 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  31.12 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  30.74 
 
 		 1486 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  31.23 
 
 		 1489 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  32.89 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  29.87 
 
 		 1443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  32.68 
 
 		 450 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  31.54 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  31.54 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  31.54 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  32.66 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  33.77 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  31.55 
 
 		 520 aa  169  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  28.71 
 
 		 469 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  31.06 
 
 		 447 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  30.85 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  28.54 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  28.48 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  27.85 
 
 		 494 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  26.51 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  26.51 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  26.25 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  27.51 
 
 		 560 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  29.74 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  25.2 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  26.83 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  28.88 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  29.22 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  27.46 
 
 		 416 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  25 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  25 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  22.33 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  25 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  25.75 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  26.45 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  26.2 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  25.97 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>