28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6438 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  100 
 
 
484 aa  1006    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  40.42 
 
 
469 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  36.71 
 
 
470 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  36.71 
 
 
470 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  36.38 
 
 
469 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  27.75 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  25.82 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  27.9 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  25.54 
 
 
469 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  26.13 
 
 
504 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  27.79 
 
 
1486 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  27.72 
 
 
444 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  28.62 
 
 
465 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  25.26 
 
 
520 aa  83.6  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  25.2 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  27.37 
 
 
1489 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  26.11 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  26.11 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  26.11 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  25.97 
 
 
1443 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  24.73 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  24.54 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  27.91 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  24.93 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  24.52 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  23.89 
 
 
447 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  24.07 
 
 
440 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  23.92 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>