More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3798 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  41.18 
 
 
1489 aa  979    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  41.32 
 
 
1486 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  100 
 
 
1443 aa  2900    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  29.65 
 
 
488 aa  245  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  32.91 
 
 
447 aa  208  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  32.91 
 
 
447 aa  208  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  32.91 
 
 
447 aa  208  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  32.14 
 
 
440 aa  206  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  32.89 
 
 
440 aa  201  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  32.74 
 
 
447 aa  195  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  31.75 
 
 
504 aa  188  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  29.87 
 
 
480 aa  180  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  30.22 
 
 
465 aa  179  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  30.79 
 
 
469 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  31.07 
 
 
444 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  30.73 
 
 
458 aa  157  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
450 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  31.83 
 
 
438 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  26.52 
 
 
520 aa  147  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  28.73 
 
 
494 aa  133  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  36.82 
 
 
434 aa  128  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  27.8 
 
 
473 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3578  hypothetical protein  30.75 
 
 
447 aa  121  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  26.65 
 
 
560 aa  112  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  34.56 
 
 
411 aa  104  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  24.05 
 
 
469 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  23.79 
 
 
470 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  23.98 
 
 
470 aa  98.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2436  cytochrome P450  24.37 
 
 
576 aa  95.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  26.59 
 
 
410 aa  95.1  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8744  hypothetical protein  29.45 
 
 
441 aa  94.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3674  cytochrome P450  24.09 
 
 
576 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  25.9 
 
 
469 aa  89  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2247  hypothetical protein  31.51 
 
 
415 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289167  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4235  hypothetical protein  29.32 
 
 
326 aa  82  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0678066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  25.32 
 
 
408 aa  80.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  23.96 
 
 
420 aa  80.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  25.97 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5959  cytochrome P450  28.07 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0244226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  24.52 
 
 
406 aa  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  27.14 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  27.43 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3627  hypothetical protein  25.95 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2099  cytochrome P450  28.65 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554694  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  28.08 
 
 
405 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  24.62 
 
 
407 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  27.56 
 
 
415 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  43.53 
 
 
523 aa  69.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4829  cytochrome P450  27.76 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  24.58 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  26.65 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  23.14 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  26.45 
 
 
403 aa  67.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  25.99 
 
 
405 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  26.98 
 
 
408 aa  67  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  24.45 
 
 
428 aa  66.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  27.74 
 
 
402 aa  64.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  24.87 
 
 
404 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  22.95 
 
 
417 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  24.17 
 
 
418 aa  63.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  26.13 
 
 
417 aa  64.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  26.13 
 
 
417 aa  64.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  26.27 
 
 
408 aa  63.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  23.61 
 
 
426 aa  63.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0512  cytochrome P450  25.65 
 
 
398 aa  63.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13559  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  24 
 
 
410 aa  62.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  23.28 
 
 
408 aa  62.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  25.98 
 
 
406 aa  62  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  24.11 
 
 
417 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  26 
 
 
400 aa  61.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  25.61 
 
 
417 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  25.06 
 
 
442 aa  61.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  26.42 
 
 
394 aa  60.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  24.54 
 
 
402 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  26.85 
 
 
407 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  26.85 
 
 
407 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  26.85 
 
 
407 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1483  cytochrome P450  27.71 
 
 
417 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3499  cytochrome P450  24.78 
 
 
422 aa  60.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.750178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  22.55 
 
 
418 aa  60.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  24.65 
 
 
404 aa  59.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  26.03 
 
 
387 aa  59.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  22.04 
 
 
405 aa  59.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  25.16 
 
 
401 aa  59.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  25.14 
 
 
422 aa  58.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  24.44 
 
 
394 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  25.15 
 
 
411 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  25.07 
 
 
422 aa  58.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3515  cytochrome P450  27.17 
 
 
404 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  24.72 
 
 
400 aa  57.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  28 
 
 
402 aa  57.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  36.47 
 
 
422 aa  57.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  24.86 
 
 
396 aa  57.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1848  cytochrome P450  25.48 
 
 
400 aa  57.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  22.66 
 
 
409 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  24.38 
 
 
392 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  24.93 
 
 
419 aa  56.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  36.71 
 
 
416 aa  56.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  24.85 
 
 
400 aa  56.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  22 
 
 
405 aa  56.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>