14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1441 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  842    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  27 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  36.07 
 
 		 1486 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  35.52 
 
 		 1489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  36.42 
 
 		 1443 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2247  hypothetical protein  34.65 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4801  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.379879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1219  hypothetical protein  22.94 
 
 		 191 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4428  hypothetical protein  25.44 
 
 		 202 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0190549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4535  hypothetical protein  21.7 
 
 		 177 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617552  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2868  hypothetical protein  24.09 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2408  hypothetical protein  26 
 
 		 157 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1636  hypothetical protein  24.55 
 
 		 186 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>