15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1219 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1219  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.203152 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4801  hypothetical protein  54.17 
 
 
232 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.379879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4428  hypothetical protein  34.9 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0190549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  29.6 
 
 
434 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2247  hypothetical protein  22.95 
 
 
415 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289167  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4235  hypothetical protein  32.41 
 
 
326 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0678066  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  22.94 
 
 
411 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  24.51 
 
 
1443 aa  51.2  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  27.19 
 
 
1489 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2408  hypothetical protein  25.93 
 
 
157 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  26.32 
 
 
1486 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3575  hypothetical protein  23.94 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4535  hypothetical protein  25.17 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617552  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1636  hypothetical protein  27.03 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2868  hypothetical protein  23.38 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>