15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4535 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4535  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  369  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617552  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1380  hypothetical protein  65.34 
 
 
203 aa  256  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0579  hypothetical protein  67.05 
 
 
186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0591  hypothetical protein  67.05 
 
 
186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0569  hypothetical protein  67.05 
 
 
186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4806  hypothetical protein  67.8 
 
 
184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1636  hypothetical protein  65.91 
 
 
186 aa  247  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4428  hypothetical protein  32.19 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0190549 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4801  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.379879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  28.85 
 
 
1486 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  27.88 
 
 
1489 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  23.29 
 
 
434 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  21.7 
 
 
411 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1219  hypothetical protein  25.17 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.203152 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  25.93 
 
 
1443 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>