More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0969 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  84.78 
 
 		 1489 aa  2532    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  100 
 
 		 1486 aa  3016    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  41.32 
 
 		 1443 aa  1011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  30.67 
 
 		 488 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  34.77 
 
 		 447 aa  205  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  34.77 
 
 		 447 aa  205  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  34.77 
 
 		 447 aa  205  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  31.1 
 
 		 480 aa  199  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  31.54 
 
 		 504 aa  197  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  33.62 
 
 		 440 aa  197  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  33.41 
 
 		 440 aa  185  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  34.58 
 
 		 465 aa  183  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  31.91 
 
 		 447 aa  181  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3578  hypothetical protein  34.01 
 
 		 447 aa  173  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  34.48 
 
 		 444 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  30.72 
 
 		 450 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  31.1 
 
 		 458 aa  155  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  29.22 
 
 		 469 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  30.59 
 
 		 438 aa  145  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  30.8 
 
 		 494 aa  138  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  27.97 
 
 		 520 aa  134  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8744  hypothetical protein  30.71 
 
 		 441 aa  132  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  27.9 
 
 		 560 aa  129  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  34.8 
 
 		 434 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2436  cytochrome P450  26.65 
 
 		 576 aa  123  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5959  cytochrome P450  32.43 
 
 		 426 aa  120  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0244226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3674  cytochrome P450  26.1 
 
 		 576 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  36.07 
 
 		 411 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  27.94 
 
 		 473 aa  113  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0387  cytochrome P450  27.67 
 
 		 427 aa  102  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0770659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3627  hypothetical protein  29.41 
 
 		 439 aa  101  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2247  hypothetical protein  30 
 
 		 415 aa  94.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  27.01 
 
 		 469 aa  94  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4235  hypothetical protein  29.59 
 
 		 326 aa  93.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  27.79 
 
 		 484 aa  94.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  25.82 
 
 		 470 aa  94  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  25.59 
 
 		 470 aa  93.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  26.57 
 
 		 469 aa  84.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  25.49 
 
 		 404 aa  77.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  26.16 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  26.65 
 
 		 415 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  26.3 
 
 		 421 aa  74.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  27.27 
 
 		 390 aa  74.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  27.86 
 
 		 417 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  26.46 
 
 		 405 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  26.63 
 
 		 427 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.27 
 
 		 411 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  27.86 
 
 		 417 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  26.46 
 
 		 405 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  26.63 
 
 		 427 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  27.53 
 
 		 407 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  26.63 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  26.53 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1483  cytochrome P450  26.98 
 
 		 417 aa  72  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  25 
 
 		 407 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4829  cytochrome P450  26.34 
 
 		 435 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  21.6 
 
 		 420 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  27.3 
 
 		 418 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.96 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.44 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.96 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  25.36 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  22.65 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  27.44 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  24.22 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  26.25 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5387  cytochrome P450  28.18 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.659302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  24.17 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  27.02 
 
 		 400 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  22.41 
 
 		 405 aa  67.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  22.57 
 
 		 794 aa  67.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  25.15 
 
 		 404 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  25.89 
 
 		 409 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  25.15 
 
 		 404 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  24.3 
 
 		 401 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  23.66 
 
 		 425 aa  67.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  28.85 
 
 		 399 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  27.05 
 
 		 390 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  26.07 
 
 		 404 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  25.5 
 
 		 393 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4984  cytochrome P450  22.55 
 
 		 409 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  25.07 
 
 		 395 aa  67  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  21.36 
 
 		 783 aa  67  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  24.26 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  25.56 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  26.94 
 
 		 419 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3069  cytochrome P450  25.93 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  25.34 
 
 		 387 aa  66.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  25.78 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  23.98 
 
 		 406 aa  66.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  23.72 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  26.1 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  25 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  25.58 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0232  cytochrome P450 monooxygenase  25.32 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  24.32 
 
 		 406 aa  64.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0622  cytochrome P450  25.66 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  22.5 
 
 		 404 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  24.87 
 
 		 428 aa  65.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1012  cytochrome P450  27.15 
 
 		 387 aa  64.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>