More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0232 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0232  cytochrome P450 monooxygenase  100 
 
 
408 aa  835    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3632  cytochrome P450 monooxygenase  66.5 
 
 
403 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4431  cytochrome P450 monooxygenase  39.95 
 
 
393 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6269  putative cytochrome P450 monooxygenase  28.53 
 
 
392 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6721  cytochrome P450  29.55 
 
 
394 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  29.77 
 
 
405 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  29.77 
 
 
405 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3733  cytochrome P450 family protein  28.79 
 
 
384 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912156  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1938  putative cytochrome P450  28.21 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0501163  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  27.44 
 
 
408 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  23.89 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  29.55 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  27.27 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  27.99 
 
 
388 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3440  putative cytochrome P450  27.46 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  23.81 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  22 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  22.25 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  27.9 
 
 
784 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  23.31 
 
 
399 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  27.9 
 
 
784 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  27.9 
 
 
784 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  27.9 
 
 
784 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  23.63 
 
 
398 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  26.62 
 
 
425 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  27.9 
 
 
784 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  21.5 
 
 
411 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  26.65 
 
 
418 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  26.65 
 
 
418 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  26.65 
 
 
418 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.55 
 
 
411 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  27.86 
 
 
426 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  27.65 
 
 
405 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  27.72 
 
 
784 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  28.35 
 
 
413 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  27.54 
 
 
784 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  27.44 
 
 
404 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  27.23 
 
 
783 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  22.5 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  22 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  27.75 
 
 
788 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  22.5 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  22.25 
 
 
411 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  23 
 
 
411 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  22.25 
 
 
411 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  23 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  27.7 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  25.73 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  24.81 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  25.37 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  25.37 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  25.37 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  25.74 
 
 
788 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  22.81 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  25.93 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  30.13 
 
 
1046 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  25.61 
 
 
489 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.49 
 
 
783 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  25.75 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  25.74 
 
 
794 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  28.4 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  28.4 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  28.4 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  26.09 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  26.96 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  26.96 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  27.86 
 
 
405 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  27.86 
 
 
405 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  28.22 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  26.46 
 
 
412 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  24.7 
 
 
398 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  26.6 
 
 
429 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  27.15 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  28.64 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  22.08 
 
 
411 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  24.26 
 
 
782 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  25.2 
 
 
380 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  26.6 
 
 
411 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  28.16 
 
 
414 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  27.02 
 
 
395 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  27.09 
 
 
400 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  27.14 
 
 
400 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  27.93 
 
 
434 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  26.81 
 
 
401 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  27.14 
 
 
400 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  25.13 
 
 
399 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  25.99 
 
 
387 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  23.66 
 
 
425 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  24.4 
 
 
402 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  26.62 
 
 
411 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  28.35 
 
 
410 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  25.83 
 
 
414 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  26.23 
 
 
775 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  26.62 
 
 
411 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  26.17 
 
 
402 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  23.82 
 
 
426 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  26.4 
 
 
406 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  26.27 
 
 
402 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  26.8 
 
 
433 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  28.19 
 
 
412 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>