More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3632 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3632  cytochrome P450 monooxygenase  100 
 
 
403 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0232  cytochrome P450 monooxygenase  66.5 
 
 
408 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4431  cytochrome P450 monooxygenase  38.73 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6721  cytochrome P450  28.82 
 
 
394 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  27.14 
 
 
418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  27.14 
 
 
418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  27.14 
 
 
418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  26.7 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  26.45 
 
 
404 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6269  putative cytochrome P450 monooxygenase  28.99 
 
 
392 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  28.72 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  28.72 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  27.89 
 
 
408 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  28.31 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  27.27 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1938  putative cytochrome P450  27.53 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0501163  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3440  putative cytochrome P450  27.71 
 
 
393 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  25.06 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  26.04 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  25.38 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  28.31 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  25.3 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  27.76 
 
 
404 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  28.04 
 
 
404 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  28.04 
 
 
404 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  29.04 
 
 
403 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  24.37 
 
 
398 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  24.88 
 
 
426 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  26.49 
 
 
413 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  25.38 
 
 
398 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  28.46 
 
 
395 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  26.49 
 
 
411 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  25.17 
 
 
411 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  25.68 
 
 
402 aa  123  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3733  cytochrome P450 family protein  26.57 
 
 
384 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912156  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.7 
 
 
411 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  25 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  27.98 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  25.33 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  28.54 
 
 
405 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  24.52 
 
 
411 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  25.43 
 
 
402 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  27.3 
 
 
412 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  26.09 
 
 
402 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  25.47 
 
 
405 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  28.12 
 
 
399 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  23.91 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  26.65 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  24.17 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  25.32 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  24.2 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  23.6 
 
 
411 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  23.6 
 
 
411 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  28.43 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  27.08 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  23.6 
 
 
411 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  27.71 
 
 
412 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  25.89 
 
 
418 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  27.57 
 
 
400 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  23.6 
 
 
411 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  24.09 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  24.64 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  27.76 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  27.76 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  27.76 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  24.78 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  28.09 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  26.58 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  28.25 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  25.69 
 
 
489 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  26.54 
 
 
425 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  27.62 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  27.91 
 
 
784 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  27.91 
 
 
784 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  29.1 
 
 
406 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  29.1 
 
 
406 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  29.1 
 
 
406 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  27.91 
 
 
784 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  27.91 
 
 
784 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  27.91 
 
 
784 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  28.1 
 
 
406 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  25.65 
 
 
392 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  25.96 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  26.14 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  26.96 
 
 
410 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  29.06 
 
 
405 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  27.18 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  27.74 
 
 
784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  24.69 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  23.93 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  27.62 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  28.91 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  29.1 
 
 
1046 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  23.96 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  27.62 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  28.03 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0622  cytochrome P450  27.93 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  26.29 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  24.77 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  24.44 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>