More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3440 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1938  putative cytochrome P450  90.08 
 
 		 393 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0501163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3440  putative cytochrome P450  100 
 
 		 393 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6269  putative cytochrome P450 monooxygenase  74.04 
 
 		 392 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3733  cytochrome P450 family protein  62.47 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6721  cytochrome P450  38.06 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4431  cytochrome P450 monooxygenase  28.06 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0232  cytochrome P450 monooxygenase  27.46 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  26.8 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.64 
 
 		 426 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3632  cytochrome P450 monooxygenase  27.71 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  25.38 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  25.19 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  24.94 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  27.74 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  24.51 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  24.75 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  25.62 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  25.64 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  24.94 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  25.5 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  26.39 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  26.11 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  25.72 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.14 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  25.8 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.31 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0556  cytochrome P450 enzyme  25.31 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0542  cytochrome P450  25.31 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.353046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  26.33 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  26.29 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  26.22 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  24.81 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  24.25 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  24.56 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  25.57 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  24.56 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  24.56 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  24.56 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  25.06 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  25.68 
 
 		 398 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  25.68 
 
 		 398 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  26.94 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  24.58 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  27.19 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  24.58 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  24.58 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  25.56 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  24.87 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  24.87 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  25.88 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  25.43 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  24.87 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  24.26 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  25.38 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  26.68 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  26.17 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  24.8 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  28.43 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  24.94 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  27.13 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  26.14 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  26.63 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  23.59 
 
 		 938 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  25.32 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  23.27 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  24.94 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  25.18 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  25.95 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  26.89 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  22.17 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  25.71 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  26.01 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  26.34 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  27.37 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  25.12 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  27.3 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  27.03 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  24.88 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  24.87 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  27.11 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  27.11 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  23.83 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  25.25 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  24.5 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  24.82 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  25.79 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  26.45 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  25.56 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  25.52 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  25.21 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  26.18 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  25.36 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  25.86 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  24.81 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  26.09 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  26.09 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  24.31 
 
 		 413 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  24.87 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  23.64 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  24.81 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>