More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0862 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  100 
 
 		 1489 aa  3022    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  84.84 
 
 		 1486 aa  2540    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  41.18 
 
 		 1443 aa  989    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  31.16 
 
 		 488 aa  233  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  33.19 
 
 		 447 aa  198  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  33.19 
 
 		 447 aa  198  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  33.19 
 
 		 447 aa  198  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  32.69 
 
 		 440 aa  196  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  31.12 
 
 		 480 aa  193  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  29.47 
 
 		 504 aa  188  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  33.39 
 
 		 465 aa  184  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  31.82 
 
 		 440 aa  180  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  30.93 
 
 		 447 aa  177  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  30.38 
 
 		 450 aa  169  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3578  hypothetical protein  33.92 
 
 		 447 aa  168  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  31.24 
 
 		 438 aa  154  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  31.24 
 
 		 444 aa  153  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  29.36 
 
 		 458 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  29.33 
 
 		 469 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  28.36 
 
 		 560 aa  134  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  31.13 
 
 		 494 aa  132  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8744  hypothetical protein  30.83 
 
 		 441 aa  132  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  25.63 
 
 		 520 aa  129  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2436  cytochrome P450  25.27 
 
 		 576 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  36.27 
 
 		 434 aa  126  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3674  cytochrome P450  25 
 
 		 576 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5959  cytochrome P450  30.52 
 
 		 426 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0244226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  26.59 
 
 		 473 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  35.52 
 
 		 411 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3627  hypothetical protein  29.46 
 
 		 439 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  29.19 
 
 		 470 aa  99.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  29.19 
 
 		 470 aa  99.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2247  hypothetical protein  31.79 
 
 		 415 aa  97.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0387  cytochrome P450  27.55 
 
 		 427 aa  96.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0770659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4235  hypothetical protein  30.98 
 
 		 326 aa  90.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  26.35 
 
 		 469 aa  88.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  26.21 
 
 		 469 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  28.06 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  26.95 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  26.67 
 
 		 391 aa  78.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  24.72 
 
 		 404 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  22.75 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  27.37 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  24.44 
 
 		 411 aa  73.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  24.48 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  25 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.96 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.53 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.53 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  24 
 
 		 422 aa  72  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.35 
 
 		 419 aa  71.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  27.41 
 
 		 418 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  23.99 
 
 		 400 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  26.28 
 
 		 425 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  26.45 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  23.96 
 
 		 418 aa  70.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  25.48 
 
 		 395 aa  70.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  24.19 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  25 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  23.53 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  26.67 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  25.56 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  25.8 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  24.04 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  25.56 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  25.56 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  24.67 
 
 		 401 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  25.57 
 
 		 396 aa  68.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  30.09 
 
 		 419 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  26.24 
 
 		 406 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  26.72 
 
 		 415 aa  67.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  21.93 
 
 		 783 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  24.1 
 
 		 405 aa  67.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  25.14 
 
 		 402 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  26.96 
 
 		 417 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  25.49 
 
 		 405 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4829  cytochrome P450  27.66 
 
 		 435 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  26.96 
 
 		 417 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  23.46 
 
 		 425 aa  67.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  25.49 
 
 		 405 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  25.82 
 
 		 411 aa  67.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  23.24 
 
 		 784 aa  67  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  21.39 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  23.24 
 
 		 784 aa  67  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  21.39 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  21.39 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  21.39 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  27.91 
 
 		 436 aa  67  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  23.24 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  24.62 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  23.97 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  25.17 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  28.34 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  27.16 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  25.85 
 
 		 427 aa  65.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  25.89 
 
 		 412 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  25.85 
 
 		 427 aa  65.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  25.16 
 
 		 412 aa  64.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  25.84 
 
 		 400 aa  63.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  26.9 
 
 		 390 aa  64.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>