29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4102 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  100 
 
 		 494 aa  992    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  34.08 
 
 		 438 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  29.76 
 
 		 469 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  31.24 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  30.8 
 
 		 1486 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  28.73 
 
 		 1443 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  30.53 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  27.06 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  28.82 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  31.13 
 
 		 1489 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  27.48 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  26.69 
 
 		 504 aa  120  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  29.98 
 
 		 444 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  28.69 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  29.09 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  27.85 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  28.7 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  28.7 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  28.7 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  25.53 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  28.78 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  27.19 
 
 		 465 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  23.97 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  26.2 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  25.78 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  24.52 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  27.97 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  36 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  37.66 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>