34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4236 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4236  peroxidase, putative  100 
 
 
465 aa  913    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0422414  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2248  peroxidase  34.84 
 
 
488 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0530  peroxidase, putative  34.75 
 
 
504 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.970895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1442  peroxidase  31.33 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.61947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0589  Dyp-type peroxidase family protein  35.79 
 
 
447 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0200082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0577  Dyp-type peroxidase  35.79 
 
 
447 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.321915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0567  Dyp-type peroxidase family protein  35.79 
 
 
447 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4429  dyp-type peroxidase family protein  34.39 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1635  Dyp-type peroxidase family protein  34.99 
 
 
440 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916297  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4802  Dyp-type peroxidase family protein  34.04 
 
 
458 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4807  Dyp-type peroxidase family protein  36.51 
 
 
440 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  33.16 
 
 
1489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  31.08 
 
 
1443 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  32.45 
 
 
1486 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2867  peroxidase  29.53 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1379  hypothetical protein  31.73 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  35.7 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1218  Dyp-type peroxidase family protein  26.72 
 
 
520 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.173076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2407  peroxidase  34.37 
 
 
438 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3577  hypothetical protein  29.01 
 
 
560 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  31.39 
 
 
473 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  26.54 
 
 
470 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  26.75 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0695  iron-dependent peroxidase-like protein  25.93 
 
 
469 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  24.02 
 
 
469 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4102  peroxidase  27.29 
 
 
494 aa  93.2  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000720759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6438  iron-dependent peroxidase-like protein  25.93 
 
 
484 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.957301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  30.24 
 
 
523 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  29.82 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  28.45 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  27.24 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  27.18 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  26.86 
 
 
416 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  33.14 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>