18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4428 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4428  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0190549 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4801  hypothetical protein  38.8 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.379879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1219  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4535  hypothetical protein  32.19 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617552  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0529  hypothetical protein  28.03 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1380  hypothetical protein  29.53 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1636  hypothetical protein  29.8 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4806  hypothetical protein  29.14 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2408  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1441  hypothetical protein  25.64 
 
 		 411 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.418942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0569  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0591  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0579  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  24.53 
 
 		 1489 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2247  hypothetical protein  27.43 
 
 		 415 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  24.31 
 
 		 1486 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4101  hypothetical protein  30 
 
 		 648 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227589 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  33.66 
 
 		 1443 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>