More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04240 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL04240  mismatch repair-related protein, putative  100 
 
 		 519 aa  1075    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 823 aa  144  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  36.22 
 
 		 872 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 819 aa  140  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 817 aa  139  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.07 
 
 		 882 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  36.76 
 
 		 905 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 793 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 793 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  37.81 
 
 		 872 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  34.19 
 
 		 850 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 859 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 928 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  37.69 
 
 		 872 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  38.12 
 
 		 965 aa  133  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  35.1 
 
 		 867 aa  133  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 862 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  37.85 
 
 		 894 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 		 883 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68406  predicted protein  38.58 
 
 		 999 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.094593 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 		 828 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 854 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 854 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45661  muts-like protein 4  40.41 
 
 		 1191 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 		 895 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 855 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  34.4 
 
 		 863 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.89 
 
 		 900 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 881 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 856 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 		 855 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 860 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 		 855 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 892 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 892 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 890 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 894 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 856 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  37.09 
 
 		 927 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 892 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 892 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 910 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 910 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 871 aa  130  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 885 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  34.33 
 
 		 823 aa  130  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 890 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.05 
 
 		 861 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 892 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  32.21 
 
 		 856 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 892 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 882 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28688  predicted protein  33.06 
 
 		 936 aa  129  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 784 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 890 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  36.76 
 
 		 1091 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  36.1 
 
 		 871 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  36.74 
 
 		 891 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  37.31 
 
 		 932 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 856 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  37.96 
 
 		 880 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 856 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.13 
 
 		 868 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 		 861 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  37.06 
 
 		 910 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  36.14 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  37.62 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  38.05 
 
 		 861 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  38.17 
 
 		 865 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 856 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  32.75 
 
 		 859 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 		 856 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  37 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  37.89 
 
 		 854 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 		 885 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  34.07 
 
 		 910 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 		 886 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 		 857 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 885 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 885 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 862 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  36.65 
 
 		 851 aa  127  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 		 856 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 885 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 872 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  35.96 
 
 		 908 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  37.37 
 
 		 888 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 885 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 858 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  33.2 
 
 		 873 aa  127  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  37.19 
 
 		 927 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  34.42 
 
 		 896 aa  127  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 		 884 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 		 884 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  36.98 
 
 		 881 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 857 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  35.12 
 
 		 872 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  36.45 
 
 		 914 aa  126  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 880 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  39.2 
 
 		 878 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>