More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68406 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  41.58 
 
 		 945 aa  702    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68406  predicted protein  100 
 
 		 999 aa  2050    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.094593 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  39.33 
 
 		 965 aa  597  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28688  predicted protein  34.46 
 
 		 936 aa  541  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163307  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  42.62 
 
 		 363 aa  280  8e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  30.11 
 
 		 895 aa  279  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  31.44 
 
 		 828 aa  270  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  32 
 
 		 860 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  31.39 
 
 		 868 aa  267  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 887 aa  266  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 		 817 aa  262  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  30.67 
 
 		 859 aa  261  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  31.06 
 
 		 793 aa  261  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  30.17 
 
 		 793 aa  259  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  30.73 
 
 		 896 aa  258  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 939 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 939 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 891 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 939 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 938 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  26.63 
 
 		 893 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 939 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 881 aa  255  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  30.42 
 
 		 895 aa  254  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  31.69 
 
 		 867 aa  252  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 855 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  26.55 
 
 		 928 aa  252  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 855 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 855 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  30.28 
 
 		 850 aa  251  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 900 aa  251  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  26.85 
 
 		 885 aa  251  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 857 aa  251  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  31.57 
 
 		 858 aa  251  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 		 819 aa  251  7e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  28.73 
 
 		 886 aa  251  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 855 aa  250  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  29.81 
 
 		 855 aa  250  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 855 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  26.61 
 
 		 891 aa  250  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 894 aa  249  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 903 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  31.61 
 
 		 865 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 885 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 		 892 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 		 892 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 		 892 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  31.34 
 
 		 892 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 848 aa  247  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  31.49 
 
 		 896 aa  248  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 855 aa  247  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  31.53 
 
 		 890 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  28.9 
 
 		 853 aa  247  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 		 1040 aa  247  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  31.53 
 
 		 892 aa  247  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  32.7 
 
 		 848 aa  247  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  31.69 
 
 		 890 aa  247  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  30.56 
 
 		 862 aa  247  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  31.69 
 
 		 892 aa  247  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  31.37 
 
 		 890 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 		 932 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 918 aa  245  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  31.63 
 
 		 881 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 872 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 872 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  28.66 
 
 		 956 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  28.01 
 
 		 881 aa  244  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 861 aa  244  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  30.42 
 
 		 856 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  28.85 
 
 		 863 aa  244  7.999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  30.54 
 
 		 904 aa  244  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 910 aa  243  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  30.42 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  29.64 
 
 		 910 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 901 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 		 858 aa  243  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 910 aa  243  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 		 853 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  30.06 
 
 		 852 aa  243  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0493  DNA mismatch repair protein MutS  27.71 
 
 		 915 aa  242  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  30.28 
 
 		 856 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  30.19 
 
 		 853 aa  241  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  31.35 
 
 		 854 aa  240  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  30.63 
 
 		 846 aa  240  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  30.25 
 
 		 853 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 871 aa  239  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 		 870 aa  240  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  30.19 
 
 		 860 aa  240  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  30.91 
 
 		 857 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 		 889 aa  240  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  30.57 
 
 		 861 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 902 aa  239  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  29.64 
 
 		 853 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  30.05 
 
 		 853 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 		 880 aa  239  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 863 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 861 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  30.05 
 
 		 853 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>