More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28688 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  41.97 
 
 		 945 aa  683    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  42.11 
 
 		 965 aa  676    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28688  predicted protein  100 
 
 		 936 aa  1927    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163307  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68406  predicted protein  34.25 
 
 		 999 aa  541  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.094593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 		 867 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  32.55 
 
 		 828 aa  304  6.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  30.42 
 
 		 928 aa  298  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  34.43 
 
 		 862 aa  297  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  35.77 
 
 		 855 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  33.61 
 
 		 857 aa  293  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  32.62 
 
 		 932 aa  292  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  34.64 
 
 		 856 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  34.46 
 
 		 856 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  28.39 
 
 		 896 aa  292  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  33.99 
 
 		 858 aa  291  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  33.8 
 
 		 858 aa  290  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 856 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  46.2 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  34.1 
 
 		 856 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  27.4 
 
 		 873 aa  286  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  30.66 
 
 		 863 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  32.93 
 
 		 859 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 887 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 862 aa  283  9e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  29.6 
 
 		 863 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 863 aa  282  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  33.5 
 
 		 910 aa  282  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  36.05 
 
 		 854 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  33.61 
 
 		 910 aa  281  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  32.94 
 
 		 871 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  33.69 
 
 		 856 aa  280  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 939 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 853 aa  280  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  31.29 
 
 		 968 aa  280  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  33.11 
 
 		 861 aa  280  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 891 aa  279  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 938 aa  279  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 939 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  29.58 
 
 		 868 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 939 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  35.03 
 
 		 939 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  33.11 
 
 		 861 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  29.94 
 
 		 859 aa  279  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 		 853 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  33.57 
 
 		 859 aa  278  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  33.66 
 
 		 851 aa  278  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  30.93 
 
 		 861 aa  278  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  27.98 
 
 		 858 aa  277  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  33.11 
 
 		 861 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 862 aa  277  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  34.86 
 
 		 893 aa  277  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  29.42 
 
 		 868 aa  277  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.43 
 
 		 900 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  33.18 
 
 		 916 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  34.97 
 
 		 854 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  30.1 
 
 		 869 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  33.49 
 
 		 851 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  33.49 
 
 		 851 aa  276  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  33.16 
 
 		 853 aa  275  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  33.44 
 
 		 882 aa  274  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  32.68 
 
 		 881 aa  274  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  35.94 
 
 		 852 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  34.51 
 
 		 863 aa  273  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  32.61 
 
 		 872 aa  273  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  34.72 
 
 		 885 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  33.9 
 
 		 854 aa  273  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  34.29 
 
 		 886 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  34.9 
 
 		 885 aa  273  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  29.4 
 
 		 930 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  32.86 
 
 		 882 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  33.87 
 
 		 872 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  34.63 
 
 		 855 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 848 aa  271  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  33.64 
 
 		 858 aa  271  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  34.95 
 
 		 891 aa  271  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  33.86 
 
 		 882 aa  270  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  31.53 
 
 		 851 aa  270  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  32.84 
 
 		 854 aa  269  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  30.1 
 
 		 895 aa  269  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  34.47 
 
 		 855 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  34.14 
 
 		 855 aa  268  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  34.04 
 
 		 889 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  34.47 
 
 		 855 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  31.69 
 
 		 895 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  32.45 
 
 		 823 aa  268  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 873 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 871 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  34.44 
 
 		 851 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  34.47 
 
 		 855 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  31.55 
 
 		 882 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  34.3 
 
 		 855 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  33.75 
 
 		 854 aa  268  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  31.43 
 
 		 856 aa  268  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  32.7 
 
 		 872 aa  268  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  30.18 
 
 		 903 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  32.69 
 
 		 872 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  34.8 
 
 		 873 aa  267  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 		 893 aa  267  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  33.45 
 
 		 922 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  32.87 
 
 		 853 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>