More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02460 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE02460  expressed protein  100 
 
 		 551 aa  1127    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02920  hypothetical protein  75.14 
 
 		 362 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06387  MFS amine transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10790)  25.07 
 
 		 525 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09472  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10530)  26.61 
 
 		 564 aa  96.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 395 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06412  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00780)  25.81 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07351  conserved hypothetical protein  22.37 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.51 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  20.87 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.06 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  23.44 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  25.68 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03580  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0622174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.62 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.24 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 419 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.48 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.69 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.35 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  22.2 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  26.58 
 
 		 459 aa  56.2  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 476 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.48 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  24.35 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.79 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  26.58 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.79 
 
 		 398 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 463 aa  54.7  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.79 
 
 		 416 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 		 539 aa  54.3  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 539 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  22.6 
 
 		 449 aa  54.3  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 391 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  20.73 
 
 		 439 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 481 aa  53.9  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.6 
 
 		 370 aa  53.9  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.14 
 
 		 579 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  23.24 
 
 		 440 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04840  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  23.66 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.74 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  24 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  20.65 
 
 		 683 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  20.95 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  21.3 
 
 		 485 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  20.89 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.77 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.71 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 412 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.26 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05628  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11060)  25.96 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.578894  normal  0.0253476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  22.45 
 
 		 394 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 413 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.98 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 528 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  26.95 
 
 		 217 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.87 
 
 		 537 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  21.55 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  20.37 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>