91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03480 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC03480  GTP-binding protein, putative  100 
 
 
642 aa  1280    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.866446  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  29.56 
 
 
521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  29.86 
 
 
597 aa  145  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  31.08 
 
 
360 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 
669 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  28.37 
 
 
544 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  29.77 
 
 
560 aa  95.1  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
717 aa  93.2  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  26.01 
 
 
443 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  25.3 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  23.53 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  26.43 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  26.67 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  25.78 
 
 
259 aa  64.7  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.65 
 
 
267 aa  63.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  24.46 
 
 
261 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  23.46 
 
 
379 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  25.1 
 
 
444 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  27.9 
 
 
265 aa  60.1  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  25.72 
 
 
374 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  25 
 
 
261 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  26.75 
 
 
281 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  29.58 
 
 
260 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  27.03 
 
 
378 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  25.62 
 
 
455 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  26.25 
 
 
499 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  25.64 
 
 
281 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  28.29 
 
 
384 aa  51.6  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  23.66 
 
 
374 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  29.41 
 
 
258 aa  50.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  27.87 
 
 
449 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  23.34 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  32.11 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  31.53 
 
 
437 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  28.4 
 
 
709 aa  48.5  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  23.04 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  29.27 
 
 
254 aa  48.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  26.32 
 
 
287 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  27.18 
 
 
436 aa  48.1  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  35.11 
 
 
449 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  23.04 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  32.98 
 
 
441 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  26.21 
 
 
288 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  24.08 
 
 
304 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  28.72 
 
 
466 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  22.22 
 
 
438 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  31.01 
 
 
301 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  30.17 
 
 
448 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 
462 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  27.39 
 
 
285 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  31.18 
 
 
458 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  22.51 
 
 
438 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  28.99 
 
 
475 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  24.07 
 
 
466 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  23.67 
 
 
283 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  31.18 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  26.61 
 
 
456 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  29.85 
 
 
475 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  29.73 
 
 
464 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  25.4 
 
 
441 aa  44.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
467 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3824  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 
480 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 
300 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
464 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.63 
 
 
293 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
488 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
488 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
488 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
464 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  24.62 
 
 
456 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  24.84 
 
 
305 aa  44.3  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
489 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
467 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  25.71 
 
 
307 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
467 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
467 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  35.71 
 
 
455 aa  44.3  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  37.68 
 
 
439 aa  43.9  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  25.3 
 
 
438 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  25.3 
 
 
438 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  31.03 
 
 
469 aa  43.9  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  30.85 
 
 
460 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 
467 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  24.53 
 
 
440 aa  43.9  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  22.35 
 
 
500 aa  43.9  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  29.73 
 
 
464 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  37.68 
 
 
439 aa  43.9  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>