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for query gene Bmul_4139 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4139  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.956348  normal  0.0272959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.3 
 
 
418 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3946  major facilitator transporter  78.13 
 
 
428 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501958  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4409  major facilitator transporter  77.25 
 
 
403 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4516  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.98 
 
 
428 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.5 
 
 
403 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338253  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.5 
 
 
403 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.46 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  42.89 
 
 
408 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  46.17 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.77 
 
 
401 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.58 
 
 
405 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.69 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.79 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4471  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.28 
 
 
402 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2187  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.88 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0859  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.88 
 
 
406 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194721  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.94 
 
 
429 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.2 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.52 
 
 
394 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 
444 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.89 
 
 
399 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 
430 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 
405 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.51 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.39 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.34 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.64 
 
 
404 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.29 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 
420 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.89 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.42 
 
 
407 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.51 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.39 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  30.1 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.61 
 
 
412 aa  121  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.14 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.3 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  27.17 
 
 
407 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.99 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.24 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.59 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.55 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.32 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  26.68 
 
 
419 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.25 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.37 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.95 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.47 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.14 
 
 
404 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.04 
 
 
412 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.52 
 
 
408 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  29.77 
 
 
392 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  32.86 
 
 
402 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 
418 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  27.27 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.3 
 
 
411 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 
498 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.58 
 
 
395 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.8 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.65 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  25.77 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.81 
 
 
461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.62 
 
 
407 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  26.39 
 
 
409 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.21 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3190  major facilitator transporter  26.99 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.79 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.93 
 
 
405 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3588  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.05 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226455  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.1 
 
 
391 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27 
 
 
401 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2184  major facilitator transporter  26.51 
 
 
398 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.95 
 
 
397 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.7 
 
 
399 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.14 
 
 
411 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 
413 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.28 
 
 
399 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.8 
 
 
412 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27 
 
 
399 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 
409 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 
405 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.06 
 
 
403 aa  107  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.12 
 
 
411 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.76 
 
 
393 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.63 
 
 
399 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.58 
 
 
398 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.43 
 
 
411 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.34 
 
 
395 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.92 
 
 
416 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  24.58 
 
 
398 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.35 
 
 
411 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.94 
 
 
398 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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